После того как очередная хунта была свергнута и к власти в стране пришло легитимно избранное правительство, 15 декабря 1983 г. была образована специальная правительственная комиссия по расследованию преступлений военных, полиции и их пособников в предыдущие восемь лет. Комиссию, которая получила название CONADEP (Национальная комиссия по вопросам похищенных граждан), возглавил известный писатель Эрнесто Сабато. Вскоре она установила, что в период с 1976 по 1983 г. в Аргентине пропало без вести не менее 11 тыс. человек. С большой долей вероятности можно считать, что все они погибли. Причем среди жертв военного режима оказались не только вооруженные члены партизанских и повстанческих отрядов, которые были практически полностью уничтожены, но и любые граждане Аргентины, заподозренные в сочувствии или тем более помощи противникам хунты – все, кто придерживался левых взглядов.
Кроме того, по данным сотрудников CONADEP, еще как минимум 900 человек были похищены и убиты членами проперонистски настроенных «отрядов смерти» еще до переворота 1976 г., а повстанцы всех мастей ответственны за уничтожение 1500 человек и совершение не менее 1800 похищений.
Но наиболее печальным событием стало то, что военную хунту и политику Хорхе Виделы рьяно поддержали главы медийных холдингов и даже руководство аргентинского отделения Римской католической церкви.
Самую ужасную «славу» за время «Г рязной войны» приобрел 601 -й разведывательный батальон (Batallon de Inteligencia 601), принимавший активное участие в процессе подготовки никарагуанских «контрас» и имевший тесные связи с американскими военными и ЦРУ. Позднее, во времена президентства Рональда Рейгана, данная воинская часть активно привлекалась сотрудниками ЦРУ для обучения и подготовки личного состава отрядов контрас для борьбы с сандинистским правительством Никарагуа (на военной базе Лепатерик в Гондурасе). В эпоху же Джимми Картера отношения с Аргентиной были практически разорваны.
Другими военными подразделениями и частями, запятнавшими свою репутацию активным участием в уничтожении инакомыслящих, стали Школа механиков ВМС Аргентины (ESMA) и Управление разведки Аргентины (Secretaria de Inteligencia, или SIDE), которое в процессе своей античеловеческой деятельности тесно сотрудничало в рамках операции «Кондор» со своими чилийскими коллегами из Управления разведки Чили (DINA) и аналогичными организациями ряда других стран Латинской Америки.
30 апреля 1977 г. Ацусена Виллафлор вместе с еще 13 женщинами, не побоявшись всей мощи, как принято было говорить в СССР, «аргентинской военщины», вышли на Плаза де Майо (в переводе – «Площадь Мая» или «Майская площадь») прямо перед «Розовым дворцом» , где заседали руководители хунты, и организовали демонстрацию, потребовав от военно-политического руководства страны вернуть им похищенных детей. Суть дела состояла в том, что родственниками пострадавших от хунты были обнаружены факты похищения новорожденных прямо в роддомах и передачи их в качестве «вознаграждения» бездетным семьям военных. Официально доказаны 500 случаев такого похищения детей военными.
Через два года, в сентябре 1979 г., Межамериканская комиссия по соблюдению прав человека после проведения расследования деятельности правительства Виделы обвинила хунту в грубом нарушении гражданских прав и общечеловеческих ценностей. Адольфо Перец Эскуивэл, глава организации по защите мира и законности, за свою деятельность по защите граждан Аргентины от произвола путчистов и их пособников, а также доведение всех ужасов «Грязной войны» до мирового сообщества был удостоен Нобелевской премии мира за 1980 г. Другой интересный случай связан с решением известного голландского футболиста Йохана Крайффа отказаться от участия в составе национальной сборной в чемпионате ФИФА на звание чемпиона мира, который проходил в 1978 г. в Аргентине. Звезда спорта объяснил свое решение протестом против нарушения прав человека аргентинской военщиной. Случайно или нет, но в финал вышли как раз сборная Аргентины и сборная Голландии. Счет оказался 3:1.
Заметим, что выступая в 1977 г. перед журналистами местных и зарубежных изданий, Видела заявил, что «категорически отвергает наличие в Аргентине концентрационных лагерей или военных учреждений и пунктов, в которых граждане удерживаются в течение длительного времени – большего, чем это настоятельно необходимо для решения задач борьбы с подрывными элементами».
После прихода к власти демократически избранного президента Рауля Рикардо Альфонсина Фулкеса (президент Аргентины с 10 декабря 1983 г. по 8 июля 1989 г.) из партии «Радикальный Гражданский Союз», который в том числе создал комиссию CONADEP, для большинства членов предыдущих военных хунт была объявлена амнистия. В том числе она коснулась и виновников развязывания «Грязной войны» и ее прямых участников. Однако принятые законодательные акты на протяжении двух десятилетий оставались крайне непопулярными в народе. В конечном итоге, в июне 2005 г., буквально в последние дни президентства Нестора Кирчнера, Верховный суд Аргентины вынес решение об отмене данных двух законов. Кроме того, с 2006 г. день 24 марта объявлен «публичным праздником и выходным днем» в Аргентине – в память о тех жертвах, которые стали возможными в результате военного переворота 24-25 марта 1976 г. С 2006 г. в стране начались судебные процессы над бывшими главарями военных хунт.