В середине 1970-х гг. по инициативе специалистов полигона по согласованию с ЦКБ — Алмаз» на комплексе С-200В велся поиск способов борьбы с воздушными командными пунктами противника, ведущими разведку и управление войсками и авиацией в прифронтовой зоне. По результатам экспериментальных работ были осуществлены доработки аппаратуры РПЦ. Полученные результаты были востребованы только в 1982 г., после событий в долине Бекаа. Специалистами ЦКБ «Алмаз», испытательного полигона, учебно-тренировочного полигона, нескольких войсковых частей и НИИ были проведены доработки комплекса С-200В для стрельбы по барражирующим целям. Для борьбы с самолетами-разведчиками и постановщиками помех, барражирующими на большом удалении от зоны ПВО, использовался режим обстрела «вдогон» со стрельбой по целям с «отрицательными» скоростями. Была экспериментально проверена возможность стрельбы по целям, летящим на высотах 30–50 м.
В ходе испытаний системы С-200В. проводившихся в конце 1960-х гг., определялись возможности системы С-200В по обнаружению тактических баллистических ракет и их уничтожению. Работы велись по мишеням, созданным на базе ракет 8К11 и 8К14. Отсутствие в составе системы средств целеуказания, способных обеспечить обнаружение и наведение РПЦ на скоростную баллистическую цель, предопределило недостаточно высокие результаты экспериментальной работы. Опытные стрельбы по мишеням, созданным на базе ракет 8К14, осуществлялись также и системой С-200М.
Для расширения боевых возможностей огневых средств системы на Сары- Шаганском полигоне в 1982 г. в опытном порядке было произведено несколько стрельб по наземным целям. Ракеты в аппаратурной части (система захвата цели) прошли незначительную доработку, остальная техника системы не дорабатывалась. В ходе опытных стрельб ракетой была уничтожена радиолокационно видимая мишень — машина с установленным на ней специальным контейнером от мишени МР-8ИЦ. При установке контейнера с радиолокационными отражателями на земле радиоконтрастность мишени резко падала и стрельба становилась малоэффективной. По результатам испытаний были сделаны выводы о возможности поражения ракетами системы типа С-200В (С-200М) мощных наземных источников помех. Ожидалась высокая эффективность стрельбы по надводным целям в пределах радиогоризонта. Но проведение доработок на комплексах в войсках для введения режима стрельбы по наземной или надводной цели было признано нецелесообразным. С другой стороны, следует отметить, что в ряде зарубежных источников сообщалось о подобном использовании средств системы С-200 в ходе боевых действий в Нагорном Карабахе.
В связи с начавшимся в 1980-е гг. переходом Войск ПВО страны на комплексы нового поколения системы С-300П с твердотопливными ракетами комплексы системы С-200 начали постепенно снимать с вооружения. К середине 1990-х гг. комплексы С-200 «Ангара» и С-200В «Вега» полностью исчезли из ПВО России. Техника поступила на базы хранения и подлежит утилизации. Автотехника, кабины и прицепы с демонтированным оборудованием передаются для реализации и использования в народном хозяйстве.
После снятия в середине 1990-х гг. с вооружения комплексов С-200 «Ангара» и С-200В (М) «Вега» производилась утилизация вооружения и оборудования. Частично оборудование и принадлежности были использованы для пополнения ЗИП оставленных на вооружении комплексов С-200Д. Помимо России комплексы системы С-200 после распада СССР остались на вооружении Азербайджана, Белоруссии, Грузии. Молдавии, Казахстана, Туркмении, Украины и Узбекистана. Став полноправными владельцами столь мощного вооружения, некоторые из стран ближнего зарубежья попытались обрести также и независимость от ранее использовавшихся полигонов в малонаселенных районах Казахстана и России. К сожалению, жертвами этих стремлений оказались 66 пассажиров и 12 членов экипажа совершавшего рейс № 1812 «Тель-Авив — Новосибирск» российского Ту-154, сбитого над Черным морем 4 октября 2001 г. в ходе учебных стрельб украинской ПВО, проводившихся на полигоне 31-го Исследовательского центра Черноморского флота в районе мыса Опук в восточном Крыму. Стрельбы проводили зенитные ракетные бригады 2-й дивизии 49-го корпуса ПВО, Среди рассматривавшихся непосредственных причин трагического инцидента упоминались возможное перенацеливание ЗУР на Ту-154 в полете после уничтожения предназначенной для нее мишени Ту-243 ракетой другого комплекса либо захват головкой самонаведения ракеты гражданского самолета еще в ходе предстартовой подготовки, К сожалению, летевший на высоте около 10 км Ту-154 на удалении 238 км находился в том же диапазоне малых значений углов места, что и ожидаемая по замыслу учений маловысотная мишень. Малое подлетное время внезапно появляющейся из- за горизонта мишени соответствовало варианту ускоренной подготовки к пуску при работе радиолокатора подсвета цели в режиме монохроматического излучения, без определения дальности до цели. В любом случае при столь печальных обстоятельствах еще раз подтвердились высокие энергетические возможности ракеты: самолет был поражен в дальней зоне, даже без реализации специальной программы обстрела высотной цели с быстрым выходом в разреженные слои атмосферы.
