Но в дальнейшем взоры проектировщиков обратились к более эффективному источнику энергетики — находившимся на борту ракеты компонентам топлива для двигателя, которые могли обеспечить также и работу бортового источника питания (БИП), предназначенного для выработки в полете как постоянного, так и переменного тока, а также и для поддержания высокого давления в гидравлической системе, обеспечивающей работу рулевых приводов. Отработка БИП была поручена в 1958 г. ОКБ-670 под руководством Л.Н. Душкина, а в дальнейшем продолжалась под руководством М М. Бондарюка. Доводка конструкции БИП и подготовка документации для его серийного производства велись в ОКБ-466 под руководством ведущих конструкторов М.Н. Шувалова и Ф.Е. Арановича. Конструктивно БИП состоял из газотурбопривода, гидроагрегата и двух электрогенераторов.
По мере выпуска рабочих чертежей к производству ракет и наземных средств комплекса были дополнительно подключены многие предприятия нескольких министерств. В частности, выпуск крупноразмерных антенных постов радиолокационных средств поручили горьковскому исходно артиллерийскому заводу № 92 и самолетостроительному заводу № 23 в подмосковных Филях.
Летом 1960 г. поблизости от Ленинграда, на полигоне Ржевка (Государственный научно-исследовательский полигон Главного артиллерийского управления), с первой из изготовленных пусковых установок начались бросковые испытания имитатора ракеты, то есть пуски неуправляемых массогабаритных макетов маршевой ступени с натурными ускорителями, что было необходимо для отработки пусковой установки и стартового участка полета.
Рабочий проект опытной пусковой установки, которой был присвоен фирменный для ЦКБ-34 индекс СМ-99, был создан в 1960 г. Первая опытная пусковая установка, выпущенная заводом "Большевик", имела короткую качающуюся часть, которая заканчивалась в районе передних роликовых опор ракеты. Необходимость стыковки наземного оборудования с бортовым оборудованием, пневмо- и электромагистралями ракеты потребовала существенного удлинения балки и введения носового разъема.
На этапе опытного проектирования в ЦКБ-34 в инициативном порядке велись проработки варианта пусковой установки с подкатными ходами (по типу ПУ СМ-63 комплекса С-75), но он не был реализован, с одной стороны, по причине громоздкости ходовой части и высокой трудоемкости процесса перевода ПУ из походного положения в боевое и обратно, а с другой стороны — из-за того, что даже на начальном этапе проектирования заказчиком не ставилась всерьез задача обеспечения мобильности ПУ.
На ранних этапах разработки эскизного проекта пусковой установки исследовались различные варианты газоотбойных и газоотражательных конструкций, предотвращающих эрозию грунта площадки при старте ракеты. Резинометаллические "ковры" были отвергнуты практически сразу. Для экспериментальных исследований на ленинградском заводе "Арсенал" был изготовлен газоотражатель рассекающего типа. Он был доставлен для испытаний на полигон Ржевка, но на пусковую установку так и не монтировался. Использование на ракете стартовых ускорителей с развернутыми наружу соплами явно сводило его эффективность практически к нулю.
Общая конструктивная схема напоминала пусковую установку СМ-63 комплекса С-75. Основными внешними отличиями были два мощных гидравлических цилиндра, примененные вместо использовавшегося в С-75 секторного механизма подъема стрелы с направляющими, отсутствие газоотражателя, а также подводимая к нижней поверхности передней части ракеты откидная рама с электровоздухоразъемами.
В ходе испытаний первого этапа, проводившихся на Ржевском полигоне с использованием так называемых ИРС — имитаторов ракет, было проведено окончательное согласование пусковой установки, ракеты, заряжающих машин и вспомогательного оборудования, определены реальные нагрузки, возникающие при старте ракеты.
В дальнейшем, исходя из результатов испытаний на полигоне Ржевка, в 1961 — 196.3 it. была выпущена опытная партия пусковых установок СМ-99А для проведения заводских и совместных испытаний в составе полигонного варианта системы С-200 па Балхаше. В свою очередь, технический проект серийной пусковой установки 5П72 был выполнен на базе СМ-99А позднее, в 1962 г.
А еще в 1960 г. по результатам проработки нескольких вариантов заряжающей машины был выпущен рабочий проект ее опытного образца с использованием компоновочной и кинематической схем, предложенных С.П. Ковалесом. Разработка проекта заряжающей машины велась под руководством А.И.Усгименко и А.Ф.Уткина. Опытная партия заряжающих машин для проведения заводских и совместных испытаний была изготовлена на Московском заводе "Машиностроитель" в период 1961–1962 гг. Рабочий проект серийного варианта машины появился в 1962 г.
Параллельно с проведением работ по проектированию и изготовлению новой зенитной ракетной системы велась подготовка к ее отработке и полномасштабным испытаниям, Расположенный в Казахстане, к западу от озера Балхаш, полигон "А" Министерства обороны следовало подготовить к приему и хранению новой техники. Для проведения испытаний уже в августе 1960 г, требовалось построить позицию радиотехнических средств и стартовую позицию в районе площадки "35" полигона. Ленинградский филиал ЦПИ-20 МО должен был провести проектирование полигонных позиций системы С-200.
