Поршневые военно-транспортные самолёты постепенно заменялись турбовинтовыми Ан-8 и Ан-12 (1961), Ан-24 (1962-1963), Ан-26 (1971-1972}. Самолёты по-прежнему входили в состав транспортных полков (по одному на каждом флоте), В авиационных дивизиях и отдельных полках по штату полагался самолёт Ан-24 (Ан-26) или, в крайнем случае, Ан-2 для обеспечения их повседневной деятельности. Несколько позже для обучения штурманов и выполнения межфлотских перевозок каждой мрад были приданы самолёты Ту-104Ш, эксплуатировавшиеся до 1982 г. Самолёты Ан-12 и вертолёты Ми-6, которые также состояли в штатах мрад, предназначались для доставки ракет и боеприпасов. В 1980 г. их передали в транспортные полки. Самолёты Ту-104 и Ан-12 обеспечивали межфлотские маневры частей и тактических групп самолётов МРА и ПЛА
В авиации СФ числились два Ту-114 для зарубежных перевозок, связанных с обеспечением подразделений и групп личного состава ВМФ, находящихся на боевой службе в удалённых районах. При необходимости они доставляли на ТОФ группы офицеров главного штаба ВМФ. В 1978 г. на смену устаревшим Ту-114 поступили Ил-62 и Ил-62М, объединённые в отдельную эскадрилью в 33-м центре в Николаеве, Последствия такого не очень продуманного решения выявились в полной мере, когда Украина самолёты прихватила и стала использовать их для коммерческих перевозок.
С 1964 г. в отдельных оплвп имелись вертолёты Ми-6, а затем Ми-8.
После настоятельных обращений командования ВМФ к ВВС удалось получить несколько самолётов Ту-134 и Ту-154, которые использовались не только для внутрифлотских перевозок. С 1989 г. стали поступать самолёты Ан-72 с двумя ТРДЦ типа Д-36.
Это первый транспортный самолёт укороченного взлёта и посадки, что обеспечивается мощной механизацией крыла и повышенной тягово-оружённостью. Особенность аэродинамической схемы - размещение двигателей над поверхностью крыла,
На военно-транспортные самолёты приходится весь объём необходимых перевозок. Какие только задачи не приходилось выполнять транспортникам. Это санитарные рейсы и полёты на спасение людей, оказавшихся в трудной ситуации, дежурство в готовности оказать помощь экипажам приземлившихся спускаемых аппаратов, учебные полёты на десантирование морских пехотинцев, тренировки боевых пловцов, доставка дальневосточных даров руководству и т.п.
Большинство полётов выполняются над морем. Североморские транспортники любят вспоминать уже ставшие далёкими годы, когда в конце 40-х годов возникла угроза войны. Командование НАТО готовило план воздушного вторжения через Северный Ледовитый океан. К этому времени промышленность только приступила к производству самолётов Ту-4, но при всём желании они не доставали до Америки. Чтобы организовать промежуточный аэродром, и создать истребительный заслон, было решено построить в арктической зоне ледовый аэродром. Необходимое оборудование доставляли экипажи транспортной авиации на стареньких Ли-2, но, несмотря на все трудности, задачу транспортный полк выполнил. И только спустя годы, по мере разрядки обстановки, надобность в таких аэродромах отпала
После чернобыльской катастрофы несколько экипажей "западных" флотов работали в зоне радиоактивного заражения.
Транспортный полк ВВС СФ не остался в стороне от кровавых бакинских событий 1 990 г. В Баку экипажи доставляли военные грузы и должны были возвращаться порожняком. Но когда толпа азербайджан-дцев обстреляла в море баржу с беженцами - семьями российских военнослужащих, которой так и не дали покинуть район конфликта, командир эскадрильи подполковник П. Макута, не дожидаясь решения командования, на свой страх и риск погрузил на самолёт женщин и детей. Бандиты на взлёте обстреляли самолёт. Впоследствии на эвакуацию беженцев бросили все силы, но морские лётчики оказались первыми. Экипажами морской авиации было эвакуировано около 3000 человек военнослужащих и членов их семей.
Первыми самолётами, на которых устанавливались станции радиоэлектронных помех, были Ли-2, предназначавшиеся для отработки приёмов использования системы "Комета" в условиях помех. Впоследствии станциями помех различного типа оборудовались Ил-28 Их сменили Ту-16СПС (Ту-16П) и Ту-22. Самолёты Ту-16СПС, как и самолёты-заправщики Ту-163, организационно входили в состав мрап, который они обеспечивали, и обычно сводились в одну эскадрилью. В одрап заправщики придавались каждой эскадрилье.
Ту-163
Буксировку воздушных мишеней производили самолёты МиГ-17', Ил-28, Ту-16, Самолёты-буксировщики на некоторых флотах объединялись в отдельные эскадрильи. Самолёты-буксировщики предназначались для обеспечения зенитных и ракетных стрельб кораблей и береговой зенитной артиллерии. Начиная с 1955 г. впервые на лётно-тактичес-ких курсах в Риге самолёты МиГ-17 приступили к буксировке объёмных мишеней ПМ-Зж. Это был планер, который при выполнении взлёта и посадки находился на короткой сцепке, а в воздухе буксировался на тросе длиной 300-400 м. Впоследствии буксировку мишеней такого типа стали производить самолёты Ил-28Р.
Кроме перечисленных задач транспортные самолёты со специальной аппаратурой на борту выполняли множество полётов в интересах флота для отработки и юстировки различных корабельных систем.