В 1994 году Россия присоединилась к программе "Партнерство ради мира". Это программа сотрудничества в военной области, в которой участвуют 16 стран НАТО и 27 других государств.
В российских Ракетных войсках стратегического назначения произошли изменения. В 1990 году расформирована 50-я ракетная армия, с управлением, расположенным в г. Смоленске. В 1992 году управление 43-й ракетной армии в г. Виннице передано Украине. К 1995 году сняты с вооружения сразу три типа МБР - УР-100, РТ-2П и МР-УР-100.
1 ноября 1997 года в целях совершенствования структуры Вооруженных Сил Российской Федерации, завершена интеграция РВСН, военно-космических сил (ВКС) и выделенных из состава войск ПВО войск ракетно-космической обороны (РКО). При этом остальные части войск ПВО объединены с Военно-воздушными силами.
С августа 1992 по май 1997 года Ракетные войска стратегического назначения возглавлял генерал-полковник Игорь Сергеев.
ИГОРЬ СЕРГЕЕВ родился в 1938 году. С 1960 года, после окончания Черноморского высшего военно-морского училища имени П.С.Нахимова, проходил службу в Ракетных войсках на различных инженерно-командных должностях. С 1973 года, после окончания командного факультета Военной академии имени Ф.Э.Дзержинского, командовал ракетным полком, ракетной дивизией. В 1980 году окончил Военную академию Генерального штаба и продолжил службу в РВСН. Был начальником штаба ракетной армии, начальником оперативного управления главного штаба РВСН, первым заместителем начальника главного штаба. С марта 1989 года по август 1992 года он - заместитель главнокомандующего РВСН по боевой подготовке. В мае 1997 года Игорь Сергеев назначен министром обороны России, ему присвоено звание Маршала Российской Федерации.
В июле 1997 года главнокомандующим РВСН назначен генерал-полковник Владимир Яковлев.
ВЛАДИМИР ЯКОВЛЕВ родился в 1954 году. Службу в Ракетных войсках стратегического назначения начал в 1971 году. Был инженером, командиром группы пуска, начальником штаба, командиром ракетного полка, командиром ракетной дивизии, начальником штаба ракетной армии. С 1994 года по 1997 год Владимир Яковлев командовал ракетной армией.
К 1997 году завершен вывод ядерных боеприпасов с территории Украины, Казахстана и Белоруссии. Вывод в Россию ядерных боезарядов из Казахстана был завершен в апреле 1994 года. Вывод ядерных боезарядов с Украины - к июню 1996 года. Вывод последних ракетных комплексов "Тополь" из Белоруссии - к ноябрю 1996 года.
23 сентября 1998 года, при посещении одной из частей ПВО, Президент Белоруссии Александр Лукашенко заявил о том, что все стартовые позиции вывезенных из Белоруссии в Россию комплексов межконтинентальных баллистических ракет будут сохранены и не подлежат уничтожению.
С 1958 по 1999 год Ракетными войсками страны осуществлено свыше 400 учебно-боевых пусков МБР и РСД с боевых стартовых позиций и полигонов. В 1999 году на вооружении российских РВСН находилось более 750 пусковых установок межконтинентальных баллистических ракет. Они несли боевое дежурство в девятнадцати ракетных дивизиях страны, дислоцированных под городами и населенными пунктами:
Алейск Алтайского края (шахтные ПУ Р-36М),
Барнаул (грунтовые ПУ "Тополь"),
Бершеть Пермской области (железнодорожные ПУ РТ-23),
Верхняя Салда (Нижний Тагил) Свердловской области (грунтовые ПУ "Тополь"),
Выползово (Бологое) Тверской области (грунтовые ПУ "Тополь"),
Гладкая Красноярского края (железнодорожные ПУ РТ-23),
Домбаровский Оренбургской области (шахтные ПУ Р-36М),
Дровяная Читинской области (грунтовые ПУ "Тополь"),
Иркутск (грунтовые ПУ "Тополь"),
Йошкар-Ола (грунтовые ПУ "Тополь"),
Канск Красноярского края (грунтовые ПУ "Тополь"),
Карталы Челябинской области (шахтные ПУ Р-36М),
Козельск Калужской области (шахтные ПУ УР-100Н),
Кострома (железнодорожные ПУ РТ-23),
Новосибирск (грунтовые ПУ "Тополь"),
Татищеве Саратовской области (шахтные ПУ УР-100Н, РТ-23 и "Тополь-М"),
Тейково Ивановской области (грунтовые ПУ "Тополь"),
Ужур Красноярского края (шахтные ПУ Р-36М),
Юрья Кировской области (грунтовые ПУ "Тополь").
27 декабря 1998 года под Татищево Саратовской области на боевое дежурство заступил 104-й ракетный полк 60- й Таманской ордена Октябрьской революции Краснознаменной ракетной дивизии 27-й ракетной армии в составе десяти ШПУ МБР "Тополь-М".