За пределами России к моменту распада СССР находились 90 ШПУ РС- 18 под городом Хмельницкий на Украине, 40 ШПУ PC-18 и 46 ПУ РС-22 под Первомайском на Украине, 52 ШПУ РС-20 под Державинском и 52 ШПУ РС-20 под Жангизтобе в Казахстане, по 27 пусковых установки "Тополь" находились вблизи городов Лида, Мозыръ и Поставы в Белоруссии. На территории этих республик находятся также арсеналы РВСН, полигон Байконур, Семипалатинский ядерный полигон, крупнейшее ракетостроительное КБ "Южное", ряд конструкторских и промышленных предприятий ракетно- космической отрасли. Производство боевой ракетной техники прекратили Государственное предприятие "Южный машиностроительный завод" в Днепропетровске и Павлоградский механический завод.
В России прекратили серийный выпуск межконтинентальных баллистических ракет и ракет средней дальности Московский Машиностроительный завод имени М.В.Хруничева, Куйбышевское ПО "Прогресс", Омское ПО "Полет", Оренбургское ПО "Стрела", Красноярский машиностроительный завод и Пермский машиностроительный завод имени В.И.Ленина.
В Российской Федерации в 1990-е годы остались два предприятия окончательной сборки твердотопливных межконтинентальных баллистических ракет наземного базирования - Государственное производственное объединение "Боткинский завод" и Пермский завод "Машиностроитель".
В 1992 году определены базы утилизации жидкотопливных МБР (бывшие арсеналы РВСН) - Пибаньшур в Удмуртии (PC-10 и PC-18) и Сурова- тиха в Нижегородской области (PC-16 и РС-20). Местом утилизации твердотопливных ракет может стать площадка ГПО "Боткинский завод".
Серия реорганизаций произошла в руководстве военно-промышленным комплексом страны. 14 ноября 1991 года упразднено союзное Министерство общего машиностроения. 28 ноября 1991 года учреждено Министерство промышленности Российской Федерации, в составе которого образован Департамент общего машиностроения.
В 1992 году на базе Министерства промышленности создан Госкомоборонпром - Государственный комитет РФ по оборонным отраслям промышленности. 8 мая 1996 года Госкомоборонпром преобразован в Министерство оборонной промышленности. 17 марта 1997 года Министерство оборонной промышленности ликвидировано, его подразделения переданы в состав Министерства экономики РФ. Ракетост- роительные предприятия переданы Российскому космическому агентству (РКА). РКА было образовано 25 февраля 1992 года. Генеральным директором является Юрий Коптев. Часть предприятий бывшего Миноборонпрома остались в составе Министерства экономики РФ.
В 1994 года Россия и Казахстан подписали соглашение об использовании космодрома Байконур. Ежегодная арендная плата России Казахстану составила 115 миллионов долларов. В этом же году космодрому Плесецк присвоено название 1-й Государственный испытательный космодром Плесецк. 1 марта 1996 года образован 2-й Государственный испытательный космодром Свободный. Он расположился в Амурской области на территории ликвидированной базы межконтинентальных баллистических ракет УР-100.
31 июля 1991 года президенты СССР и США Михаил Горбачев и Джордж Буш подписали Договор об ограничении стратегических наступательных вооружений (СНВ-1). Договор предусматривает сокращение советских тяжелых межконтинентальных баллистических ракет РС-20 с 308 до 154 единиц. Количество развернутых мобильных МБР не может превышать 1 100 единиц. Каждая сторона обязалась сократить к 1997 году количество стратегических наступательных боезарядов до 6 000 единиц. При этом количество стратегических носителей (МБР, БРПЛ и СБ) не должно превышать 1 600 единиц с каждой стороны.
Договор накладывает определенные ограничения на порядок перемещения мобильных пусковых установок "Тополь" в позиционных районах. В ракетных дивизиях БЖРК количество железнодорожных комплексов, находящихся на маршрутах боевого патрулирования, не может превышать пятидесяти процентов от их общего количества. Договор СНВ-1 ратифицирован парламентами обеих стран.
3 января 1993 года президент РФ Борис Ельцин и президент США Джордж Буш подписали Договор об ограничении стратегических наступательных вооружений (СНВ-2). В соответствии с этим договором стороны ограничивают количество стратегических боезарядов на МБР, БРПЛ и СБ числом в 3 000 - 3 500 единиц. Уничтожаются тяжелые многозарядные МБР. США должны ликвидировать все пятьдесят межконтинентальных баллистических ракет MX, а также разгрузить МБР "Минитмен-III", переоборудовав ракеты в моноблочные.
Российская Федерация может иметь на вооружении моноблочные межконтинентальные баллистические ракеты наземного базирования. МБР с разделяющимися головными частями РС-20 и РС-22 должны быть ликвидированы. На вооружении России к 2003 году должны остаться 105 пусковых установок моноблочных МБР PC-18 (боевые ступени разведения не уничтожаются). Часть шахтных пусковых установок, оставшихся после ликвидации ракет РС-20, РС-22 и. отслуживших срок РС-18, могут быть, после переоборудования, заряжены новыми ракетами "Тополь-М". Продолжат боевое дежурство мобильные комплексы "Тополь".
26 сентября 1997 года министр иностранных дел России и госсекретарь США подписали "Протокол к Договору между Россией и США о дальнейшем сокращении и ограничении стратегических наступательных вооружений (СНВ-2) от 3 января 1993 г.". Протоколом продлены и уточнены некоторые сроки реализации договора СНВ-2, в частности, сроки ликвидации тяжелых МБР. Сроки ликвидации или разгрузки многозарядных МБР отодвинуты до 31 декабря 2007 года. К этому времени передвинут и срок снижения числа стратегических боезарядов до 3 500 единиц.