Вхождение этих земель в Австрийскую империю было сложным и медленным, для этого потребовалась гибкая политика, удача и несколько войн.
Одним из препятствий на пути абсолютного правления Габсбургов на этих землях были графы Цилли.
Возвышение этой семьи из центральной Словении началось во второй трети XIV века. После того, как им были дарованы большие поместья в центральной Штирии, Крайне, Каринтиии и Хорватии, они стали одной из могущественных семей юго-восточной Европы.
В 1396 году граф Герман II Цилли (Цельский) командовал войском Штирии в битве при Никополе. Армия Османской империи выиграла это сражение, но граф спас жизнь венгерскому королю Сигизмунду Люксембургскому (с 1433 года император Священной Римской Империи). После этого между графом и королем установились дружеские отношения, которые были закреплены браком короля на дочери Германа II Барбаре.
В 1436 году император возвел графов Цилли в герцоги, что привело к вражде с Фридрихом V Габсбургом (с 1452 года император Священной римской империи), который формально был их сеньором.
Точка в конфликте была поставлена в 1443 году, когда был подписан договор, один из пунктов которого предполагал взаимное наследование земель, в случае отсутствия наследников одной из семей.
Казармы 27-го горного полка Ландвера (k.k. Landwehr-Kasarne) на дороге Рошка цеста д.2 (Roska cesta) в Любляне построены в 1899 году
Но, несмотря на это, после гибели в 1456 году последнего из рода Цилли (Циллеи) графа Ортенбургского, Фридрих должен был бороться за земли с его вдовой Каталиной, венгерским королем Ладиславом Постумом, графом Герц и хорватскими графами Франкопан.
Правление Фридриха III было отмечено и рядом других конфликтов. Это противостояние с младшим братом Альбертом VI, венгерским королем Матьяшем Хуньяди (Матвей I Корвин), венецианцами и мятежными дворянами в Штирии. Его правление также было отмечено рядом турецких набегов на юго-восточные границы империи.
Турецкие набеги были самым длительным и разрушительным конфликтом этого периода. Они начались в начале XV века и продолжались (с разной силой) в течение последующих трех столетий.
И хотя Словения отстояла от основных маршрутов продвижения османских войск в юго-восточной части империи и набеги совершались не турецкими регулярными войсками, а подчиненными им христианами из Боснии и Сербии, они принесли на эти земли опустошение. Поля не обрабатывались и были бесплодны, деревни разграблены, многие жители были убиты или угнаны.
Вскоре после начала набегов стало ясно, что старая военная организация не может справиться с новой угрозой. Реорганизация стала необходима и с появлением огнестрельного оружия, которое очень повлияло на способы ведения боевых действий. Поэтому Штирия, Каринтия и Крайна объединили свои силы.
Традиционное в тот период феодальное ополчение из местных дворян и крестьянской милиции оказалось непригодно для выполнения этих задач. В результате, оно было дополнено наемниками-ландскнехтами, нанятыми на деньги короля и местной знати. Сначала это были в основном иностранцы, затем их стали нанимать из местных жителей, которые были более надежны и менее склонны к грабежам местного населения.
В начале XVI века три земли внутренней Австрии начали возводить линию обороны в соседней Хорватии. Она превратилась в сложную систему обороны и стала известна как «Военная граница». Таким образом, земли современной Хорватии были разделены Веной на две части - военную и гражданскую. В военную вошли населенные сербами территории, в гражданскую - непосредственно те районы, которые не соприкасались с Османской империей.
«Военная граница» и учреждения, которые были созданы для управления ей, стали основой постоянной военной и оборонительной системы государства Габсбургов.
Во второй половине XVII века и в начале XVIII имперская армия под руководством Евгения Савойского провела несколько успешных кампаний против турок на Балканах и изгнала их из Венгрии. Также она с большим успехом сражалась в Войне за испанское наследство.
Сейчас трудно сказать сколько солдат словенцев было в рядах этой армии и принимало участие в этих сражениях, так как полки состояли из наемником со всех частей империи, однако, известный словенский ученый и писатель Янез Вальвазор (1641-1693 гг.) утверждал, что чрезвычайно большое количество наемников из Крайны служило не только в имперской армии, но и в венецианской и испанской армиях.
Правление Марии Терезии и ее войны с прусским королем Фридрихом Великим принесло существенное изменение в армию Австрийской империи. Была введена выборочная пожизненная военная служба, что стало важным поворотным моментом в военной истории габсбургских земель. Вместо полков кадровых военных, армия теперь состояла из рекрутов. Они были набраны в соответствии с потребностями и средствами государства. На словенских землях было создано несколько военных округов (Werbebezirk). В каждом округе было предусмотрено размещение полка пехоты. Полк №16 размещался в Мариборе, №45 в Леобене, №26 в Целовце (Клагенфурт), №13 в Горице (Герц, Гориция) и №43 в Любляне. Все эти полки формировались из словенцев.