Начиная с 2004 г. были реконструированы или построены международные аэропорты в Нахичевани, Гяндже, Закатале, Ленкорани и Габале, вновь открыт местный аэропорт Евлах. Подвергся основательной модернизации вертодром в Забрате. По словам главы государства, в прежние годы состояние этих аэропортов было не столь радостным, они находились в полуразрушенном состоянии. А сегодня их инфраструктура отвечает самым высоким стандартам, пассажирам оказываются высококлассные услуги. В настоящее время обсуждается строительство нового аэропорта близ Баку, а также еще одного — на севере страны.
Выстроенная аэродромная сеть выгодно отличается от советского наследия в части укрупнения ее взлетно-посадочных полос, позволяющих принимать современную средне-, а зачастую и дальнемагистральную технику. В условиях строительства автомобильных дорог, а также в силу компактности взаимного расположения новые аэропорты в большинстве своем ориентированы в первую очередь на обслуживание международного пассажирского и грузового потока. Так, расстояние между Баку и Гянджей составляет около 350 км (путь на машине займет около 5 ч), Закаталой — 380 км (5 ч), Ленкоранью — 280 км (4 час.), Габалой — 215 км (3 ч), Евлахом — 280 км (4 ч). В этой связи отдельно стоит выделить только аэропорт Нахичевани — сюда ежедневно летают самолеты из Баку, что определяется географическим статусом Нахичеванской Автономной республики — эксклава Азербайджана.

В течение 2007–2008 гг. авиакомпания AZAL получила с завода в Тулузе четыре новых 70-местных ATR-72-500, которые эксплуатировались в Азербайджане до весны-лета этого года, после чего были заменены четырьмя новыми реактивными Е190, которые сохранили не только регистрационные номера «турбопропов», но даже их имена собственные
Третий Ан-140-100 для AZAL до Азербайджана так и не добрался. После катастрофы под Баку 23 декабря 2005 г. эксплуатация второго поставленного авиакомпании Ан-140-100 была остановлена, и в 2008 г. его возвратили ХГАПП, где вместе с третьей машиной он так и остается до сих пор. Харьков, сентябрь 2007 г.
Помимо двух новых 50-местных «регионалов» ATR-42-500, в апреле 2008 г. в Азербайджан поступила еще одна такая машина, которая использовалась в VIP-варианте компанией SW Business Aviation
Один из последних серийных Boeing 727–200 выпуска 1981 г. с 2005 г. летает в Азербайджане и с весны 2008 г. используется SW Business Aviation для специальных чартерных перевозок. Ростов-на-Дону, май 2012 г.
Высоко сижу — далеко гляжу
В развитии гражданской авиации азербайджанские власти продемонстрировали комплексный подход. Помимо авиапарка и аэропортов была успешно модернизирована национальная система управления воздушным движением. Услуги аэронавигационного обслуживания в воздушном пространстве Азербайджанской Республики и всех ее аэропортах предоставляет «Азераэронавигация» (AZANS) — подразделение ЗАО «Азербайджан Хава Йоллары». Это предприятие было создано в 1996 г в соответствии с требованиями TCAO. Структура управляет полетами воздушных судов в пределах сухопутных и водных границ Азербайджанской Республики на территории 165,4 тыс. км², из них около 47 % приходится на акваторию Каспийского моря. Большая доля радиолокационного сопровождения приходится и на вертолеты, которые выполняют полеты на нефтяные платформы на Каспии. Протяженность воздушного коридора, курируемого управлением, составляет более 8 тыс. км. В 2012 г AZANS обслужила 130 тыс. воздушных судов, в т. ч. 80 тыс. транзитных.
Азербайджанская служба аэронавигации одной из первых в СНГ интегрировалась в мировое авиахозяйство. Поэтапно были внедрены автоматизированная система EUROCAT с цифровой голосовой связью, интегрированная система управления воздушным движением в бакинском аэропорту, установлено оборудование для спутниковой связи и метеорологического наблюдения от ведущих производителей Европы. Азербайджан был активным участником двух проектов Европейского союза под названием «Южное кольцо», в рамках которых и проходила унификация систем управления воздушным движением в соответствии с международными стандартами. В 1998 г. на базе AZANS впервые в СНГ создана авиационная метеорологическая служба, обеспечивающая сводками, метеорологическими бюллетенями и данными все аэродромы и полеты всех воздушных судов. Для того чтобы пространство было по возможности «бесшовным», «Азераэронавигация» ввела футовую систему измерений. В 2005 г. внедрены сокращенные интервалы вертикального эшелонирования (RVSM).
Апогеем модернизации системы управления воздушным движением Азербайджана стало открытие 2 октября 2013 г нового здания Главного центра УВД AZANS для обеспечения пропуска возрастающего потока самолетов через воздушное пространство республики. Общая площадь объекта составила 5 тыс. м², а его высота вместе с диспетчерской башней — 65 м. На втором этаже сооружения расположен операционный зал, из которого осуществляется управление и контроль за воздушным движением на всей территории Азербайджанской Республики. По словам местных властей, сегодня многие авиакомпании мира, совершая полеты из Европы в Азию и обратно, отдают предпочтение воздушному пространству Азербайджана.