В условиях совершенствования авиации ПВО офицеры Центра решали задачи по подготовке летно-технического состава, осваивавшего новые типы авиационной техники и обеспечению проведения летно-тактических учений с боевыми стрельбами. Нагрузка была действительно нешуточная, ведь сюда ежегодно передислоцировались на своих самолетах — от Су-9 до МиГ-25 — и проходили проверку на боевую выучку практически все полки авиации ПВО страны. Кроме того, на аэродроме практически постоянно звучала иностранная речь: для проведения боевых стрельб в Советский Союз прилетали «гости» из Чехословакии, Венгрии, Югославии, Польши, Болгарии, Кубы, Вьетнама, Южного Йемена, Албании и других стран. Поэтому вплоть до конца 80-х гг. Центр летал на двух типах истребителей: первая эскадрилья — на МиГ-21бис, а вторая и третья — на МиГ-23МЛД.
В конце 70-х гг. объем летной работы на аэродроме значительно возрос. Неудивительно, что в такой ситуации было принято совершенно логичное решение о начале строительства на южной окраине Астрахани нового международного аэропорта «Нариманово», призванного разгрузить «Приволжский» и обеспечить пассажиров Аэрофлота более комфортными условиями для отправления в путешествие по стране и за ее пределы. Положительный эффект от данного решения был очевиден, и командование, инструкторский и инженерно-технический состав 116-го Центра смогли, как говорится «вздохнуть свободно», сосредоточившись на организации и обеспечении проведения учений самого различного уровня сложности. К концу 80-х гг. совокупное число боевых стрельб приблизилось к 7000, было запущено и сброшено более 11 тыс. мишеней различных типов. В конце 1988 г. астраханский Центр, первым среди частей ПВО СССР, приступил к освоению истребителей четвертого поколения МиГ-29. Самые опытные летчики и технический состав убыли для переучивания на МиГ-29 в Л ипецк. Первая эскадрилья Центра сдала свои МиГ-21бис на базу хранения и, начиная с 1 февраля 1989 г., стала получать МиГ-29. До конца года Центр принял 12 боевых машин и четыре «спарки», сохранив МиГ-23МЛД во второй и третьей эскадрильях.
Закончив в сжатые сроки переучивание на МиГ-29, летчики первой эскадрильи полностью влились в работу по практическому применению своих истребителей. Однако уже через полтора года, в ноябре 1990-го, все МиГ-29 покинули «Приволжский»: решением командования их передали на авиабазу в Красноводске (Туркестанский военный округ), где располагался 18-й Центр боевого применения истребительной авиации ПВО.
Вернулись МиГ-29 в Астрахань только спустя почти десять лет, в 1999 г., при этом все «двадцать третьи» 116-го Центра были сданы на хранение в подмосковную Кубинку. Самолетами МиГ-29 была оснащена и вторая эскадрилья Центра — но это уже была техника с солидным «жизненным опытом», поступавшая с баз хранения и авиаремонтных предприятий. В итоге, к 2000 г. Центр располагал почти четырьмя десятками МиГ-29 в двух эскадрильях, а также отдельной эскадрильей с вертолетами Ми-8 и другой авиатехникой.
После распада СССР и сокращения военной авиации работы на аэродроме «Приволжский» меньше не стало. Во-первых, в 1993 г. под Астрахань из Бомборы (Абхазия) вывели 529-й ИАП на истребителях Су-27, и у 116-го Центра появился новый сосед по аэродрому (вскоре, в результате его слияния с 393-м гвардейским Барановическим ИАП, здесь был создан новый 209-й гвардейский ИАП на самолетах Су-27, затем объединившийся в 2002 г. с 562-м ИАП и переформированный в 3-й гвардейский ИАП с базированием на аэродроме «Крымск»).
Во-вторых, после перехода авиабазы в Марах и 18-го ЦБП в Красноводске под юрисдикцию Туркменистана, на 116-й УЦБПА легла функция проверки практических навыков ведения воздушного боя и применения авиационных средств поражения всех истребительных полков России. С марта 2001 г. личный состав центра приступил к выполнению задач боевого дежурства по противовоздушной обороне страны. Помимо этого, в рамках межправительственных договоренностей, персонал Центра помогает оттачивать боевое мастерство летчикам из дружественной Белоруссии.
Летный состав теперь просто обязан идти «на шаг впереди». Понимая это, командовавшие Центром в период с 1993 по 2004 гг. заслуженные военные летчики России полковники Николай Ясников, Юрий Джамгаев и Тагир Гаджиев прикладывали все усилия для того, чтобы их офицеры поднимались в небо чаще и не ограничивались общепринятой программой подготовки. Не стоит забывать, что делать это было весьма непросто, так как в те годы наши ВВС преследовали постоянные проблемы с поставками топлива и отсутствием запчастей для самолетов. Вчерашние курсанты, недавно пришедшие из авиационных училищ и вынужденные в других авиаполках заниматься летной подготовкой исключительно по остаточному принципу, здесь всегда имели максимальные возможности для практических полетов. Приятно видеть, что такой подход сохранился и до настоящего времени. Например, закончившие в 2007 г. Армавирское училище капитаны Игорь Мищенко, Алексей Титаренко и Евгений Бурухин, выпустившиеся на самолетах Л-39, переучились в Центре на МиГ-29 и сегодня уже осуществляют самостоятельные вылеты на истребителях четвертого поколения. Самое молодое поколение 116-го УЦБПА, выпускники 2008 г. Сергей Кантемиров, Никита Корягин, Виктор Букотин, Андрей Гордиенко и Александр Тихенко, также не отстают от более опытных товарищей — в ближайшее время они должны освоить основы сложного и высшего пилотажа, получив категорию военных летчиков третьего класса. Нельзя не заметить, что атмосфера и традиции, сформировавшиеся в Центре еще в советские времена и не утерянные в сложные 90-е, притягивают в прославленный коллектив летчиков в нескольких поколениях: капитаны Владимир Градусов, Андрей Маликов и Игорь Крицкий считают для себя единственным правильным жизненным путем дорогу, по которой прошли их отцы.