Первоначально система С-200 поступала на вооружение зенитных ракетных полков дальнего действия, состоящих из 3–5 огневых дивизионов, технического дивизиона, подразделений управлении и обеспечения, а также бригад смешанного состава, оснащавшихся комплексами разных типов.
Одной из первых ракетную систему С-200 "Ангара" получила 79-я зенитная ракетная бригада Ярославского соединения ПВО. в 1966 г. преобразованная из 240-го Гвардейского зенитного ракетного полка и в августе 1967 г. заступившая на боевое дежурство с новыми комплексами. В состав 79-ой бригады входило три зенитных ракетных дивизиона С-75 и командный пункте пятью стрельбовыми каналами С-200. Реализация общего плана развертывания комплексов системы С-200 завершилась в 1973–1974 гг. после размещения ЗРК под Воронежем и под Рязанью.
С течением времени представления военных об оптимальной структуре построения зенитных ракетных частей менялись. Война во Вьетнаме велась с применением новой тактики действий ударной авиации. Прорыв к цели осуществлялся на малых высотах, под нижней границей зоны поражения поставлявшихся из СССР комплексов СА-75 "Двина", с обеспечением прикрытия пассивными и активными помехами на частотах станций наведения ракет, радиоэлектронного подавления РЛС обнаружения и целеуказания. Для повышения эффективности действий ударных самолетов и снижения их потерь в налетах участвовали специально выделяемые группы подавления и уничтожения зенитных комплексов.
Для повышения боевой устойчивости зенитных ракетных комплексов большой дальности С-200 по рекомендации комиссии по совместным испытаниям, было признано целесообразным объединять их под единым командованием с маловысотными комплексами системы С-125. Стали формироваться зенитные ракетные бригады смешанного состава, включавшие командный пункт с 2–3 стрельбовыми каналами С-200 по шесть пусковых установок и два-три зенитных ракетных дивизиона С-125, оснащенные четырьмя пусковыми установками. Совокупность командного пункта и двух-трех стрельбовых каналов С-200 стала именоваться группой дивизионов.
Новая схема организации с относительно небольшим числом пусковых установок С-200 в бригаде позволила разместить зенитные ракетные комплексы большой дальности в большем числе районов страны и, в какой-то мере, отражала тот факт, что к моменту принятия комплекса на вооружение заданная при разработке комплектация пятью стрельбовыми каналами представлялась несколько избыточной, гак как уже мало соответствовала сложившейся обстановке.
Столь активно пропагандировавшиеся в конце 1950-х гг. американские программы создания сверхскоростных высотных бомбардировщиков и крылатых ракет не были завершены из-за высокой стоимости развертывания новых систем вооружения и их явной уязвимости от зенитных ракетных комплексов. С учетом опыта войны во Вьетнаме и серии конфликтов на Ближнем Востоке в США даже тяжелые околозвуковые В-52 были доработаны для действий на малых высотах. Из реальных же специфических целей для системы С-200 оставались только действительно скоростные и высотные разведчики SR-71, а также самолеты дальнего радиолокационного дозора и постановщики активных помех, действующие с большего удаления, но в пределах радиолокационной видимости. Все перечисленные объекты были целями не массовыми и 12–18 пусковых установок в зенитной ракетной части ПВО должно было вполне хватить для решения боевых задач, как в мирное, так и в военное время.
Высокая эффективность отечественных ракет с полуактивным радиолокационным наведением подтвердилась исключительно успешным применением ЗРК "Квадрат" (экспортного варианта разработанного для ПВО Сухопутных войск ЗРК "Куб") в ходе войны па Ближнем Востоке в октябре 1973 г.
Развертывание комплекса С-200 оказалось целесообразным с учетом последующего принятия на вооружение в США управляемой ракеты класса "воздух-поверхность" SRAM (AGM-69A, Short Range Attack Missile) с дальностью пуска 160 км при пуске с малых высот и 320 км — с больших. Эта ракета как раз и предназначалась для борьбы со средствами ПВО средней и малой дальности, а также для нанесения ударов по другим заранее обнаруженным целям и объектам. В качестве носителей ракеты могли применяться бомбардировщики B-52G и В-52Н. несущие по 20 ракет (из них восемь — в пусковых установках барабанного типа, 12 — на подкрыльных пилонах), FB-111, оснащаемые шестью ракетами, а позднее и B-1А на которых размещалось до 32 ракет. При отнесении позиций С-200 вперед от обороняемого объекта средства этой системы позволяли уничтожать самолеты-носители ракет SRAM еще до их запуска, что позволяло рассчитывать на повышение живучести всей системы ПВО.
Несмотря на свой эффектный вид, ракеты системы С-200 ни разу не демонстрировались на парадах в СССР. Незначительное количество публикаций фотоснимков ракеты и пусковой установки появилось к концу 1980-х гг Однако при наличии средств космической разведки скрыть факт и масштабы массового развертывания нового комплекса не удалось. Система С-200 получила в США условное обозначение SA-5. Но многие годы в зарубежных справочниках под этим обозначением публиковали фотографии ракет комплекса "Даль", неоднократно отснятых на Красной и Дворцовой площадях двух столиц государства.
