В итоге 4 июля 1959 г. руководством страны было принято Постановление № 735–338. в соответствии с которым в качестве зенитной для системы С-125 была принята ракета типа В-600. Эта ракета должна была быть представлена на совместные летные испытания в I кв. 1960 г. Вариант ракеты для Войск ПВО страны взамен В-601 получил наименование В-600П (несекретный индекс — 5В24), а корабельная ракета продолжала именоваться В-600 (4К90). С учетом больших энергетических возможностей ракеты В-601) по сравнению с В-625 перед ОКБ-2 одновременно была поставлена задача расширить зоны поражения комплекса, в том числе обеспечить диапазон высот перехвата целей от 200–300 до 10000 м.
Этим же Постановлением работы по ракете В-625 были прекращены. Тем не менее во второй половине 1959 т. на полигон было доставлено несколько ракет В-625, доработанных на заводе № 82. Создатели ракеты надеялись провести испытания в замкнутом контуре управления в составе комплекса С-125. но соответствующего разрешения не последовало. Как говорится — поезд ушел! Разработчикам В-625 оставалось довольствоваться лишь тем, что своей работой они дали "путевку в жизнь" аэродинамической схеме "поворотное крыло", использованной в те же годы для ракет, разрабатывавшихся для ЗРК "Круг" и "Куб".
Смена основного разработчика ракеты определила и некоторые изменения в составе соисполнителей. Аппаратура радиоуправления разрабатывалась КБ-1, автопилот — ОКБ-118, боевая часть — НИИ-6, топливные заряды — НИИ-125, предохранительно-исполнительный механизм — НИИ-222, радиовзрыватель — НИИ-504. Практически все они были ранее задействованы в разработке корабельной ракеты В-600.
Ракета В-600П стала первой советской твердотопливной ЗУР. Как уже отмечалось. крайне низкое совершенство "пороховых" двигателей тех лет и. в какой-то мерс, неуверенность в достижимости заявленных характеристик определили исполнение ракеты с довольно скромным уровнем летно-технических характеристик по двухступенчатой схеме.
Маршевая ступень, выполненная по аэродинамической схеме "утка", оснащалась цельноповоротными аэродинамическими рулями для управления по тангажу и рысканию, а стабилизация по крену осуществлялась элеронами, расположенными на консолях крыльев только в одной из плоскостей. Схема "утка" способствовала достижению высокой маневренности при минимальных потерях на управление при полете на малых высотах.
Стремление сосредоточить почти все приборы управления и элементы рулевого привода, включая рулевую машинку элеронов, в одной зоне, перед двигателем. привело к непривычному конструктивному решению — открытому размещению жесткой тяги кинематики привода элеронов, протянутой вдоль корпуса маршевого двигателя.
С учетом того, что для проектировавшейся ОКБ завода № 82 ракеты В-625 уже были разработаны пусковая установка СМ-78 и транспортно-заряжаюшая машина ПР-14, конструкторским коллективам ЦКБ-34 и ГСКБ пришлось внести ряд доработок для обеспечения их применения совместно с ракетой В-600П. Эта работа была начата еще весной 1959 г. Доработанная пусковая установка получила обозначение СМ-78А. В ГСКБ была спроектирована транспортно-заряжаюшая машина ПР-14А, которая использовалась совместно с опытной пусковой установкой СМ-78А, а позднее — и с серийными двухбалочными пусковыми установками типа СМ-78А1 (5П71). Всего в ГСКБ для системы С-125 было разработано 3 агрегата. Для перевозки ракет в специальной таре разрабатывался автопоезд в составе седельного тягача и полуприцепа, для перегрузки ракет в таре — автопогрузчик "4030".
Первые испытании В-600П в замкнутом контуре представляли собой пуски по электронной цели — "кресту" с параметрами: высота 5 км, дальность 12 км. Первый из них состоялся 10 июля 1959 г.
Несмотря на то, что с подключением ОКБ-2 качество исполнения работ заметно возросло, дальнейшие испытания В-600П не обходились без трудностей. С июня 1959 г. по февраль 1960 г. на полигоне было произведено 30 пусков ракеты В-600П. в том числе 23 пуска в замкнутом контуре управления, 12 из которых прошли неудачно — большей частью из-за проблем с аппаратурой управления. Тактико-технические характеристики ракеты не во всем соответствовали требованиям, "уточненным" Постановлением от 4 июля 1959 г. К началу 1960 г. еще не завершилась доработка пусковой установки СМ-78 и транспортно-заряжающей машины ПР-14 под ракету В-600П, не был подготовлен к испытаниям магнетрон "Боржом-М2". Задерживались поставки радиовзрывателей для ракет, завод № 663 не обеспечил своевременную поставку блоков радиоуправления и радиовизирования УР-20. Саратовский завод № 213 поставил только 10 автопилотов АП-600П из запланированных 59.
В июле 1960 г. в Капустин Яр в очередной раз приехал Н.С. Хрущев. В числе прочих достижений ракетчиков была показана и боевая работа С-125. Предполагалось, что новые ракеты поразят на глазах руководства страны два самолета-мишени. Проблем с выполнением этой, уже отработанной в ходе испытаний задачи не ожидалось. Но, как вспоминал один из разработчиков С-125, сотрудник КБ-1 Евгений Иванович Никифоров, на этот раз сработал "генеральский эффект" — в присутствии важного лица, казалось бы, вполне налаженная работа вдруг разлаживается!