Практически одновременно из CLUA поступила крупная партия управляемых ракет AIM- 90 «Сайдуиндер» с ИК ГСН и систем РЭБ. Теперь угроза со стороны ЗРК С-75 парировалась постановкой помех РЛС разведки целей и станциям наведения ракет (СНР). Собственно прорыв в египетское воздушное пространство по-прежнему осуществлялся на предельно малых высотах, часто с «облизыванием» рельефа местности и использованием естественных препятствий в качестве прикрытия, что серьезно осложняло работу расчетов ЗРК. К тому же, естественная маскировка полета на фоне земли дополнилась маскировкой на фоне искусственных «завес».
После появления «Фантомов» типовое распределение целей выглядело следующим образом: штурмовики «Скайхок» обрабатывают передний край, истребители-бомбардировщики «Фантом» совершают глубокие рейды, а истребители «Мираж» осуществляют прикрытие тех и других способом подвижного заслона, а также выполняют доразведку целей. Сверхзвуковые «Фантомы» по одним и тем же объектам со «Скайхоками», как правило, не действовали. Зона внимания экипажей F-4 охватывала вторые эшелоны размещаемых вдоль Суэцкого канала египетских войск, позиции прикрывавших их ЗРК С-75, а также аэродромы и важные промышленные объекты в глубине страны.
27 ноября 1969 г. наши советники впервые отметили, что наряду с «Миражами», в воздушных боях начали принимать участие и «Фантомы». В то же время, согласно израильским официальным данным первую победу F-4 со «звездами Давида» одержал 11 ноября 1969 г. Тогда отличился экипаж командира 201 -й эскадрильи Эхуда Ханкина и Эйала Ахикара, уничтоживший МиГ-21. Впрочем, жить им оставалось недолго. Не прошло и недели, как 17 ноября этот экипаж не вернулся после налета на иорданскую РЛС, использовавшуюся для наведения египетских перехватчиков.
В тот же день, 11 ноября, вновь заявили о себе «Миражи»-«охотники», внезапно атаковавшие взлетавшие с аэродрома в Иншасе звено «МиГов» 104-й авиабригады. Фактически, от уничтожения группу тогда спасло то, что вдогонку за набиравшими высоту МиГ-21 устремились и «Миражи», внезапно вошедшие в зону радиовидимости египетских радаров. Не растерявшийся штурман наземного поста наведения тут же подал сигнал о появлении противника сзади, и ведущий звена «МиГов» тут же повел группу на косую петлю, надеясь выйти противнику на встречно-пересекающийся курс. Он опоздал всего лишь чуть-чутъ: ведущий пары «Миражей» успел-таки выпустить два «Шафрира» по ведомому второй пары, который был сбит. В последовавшем поединке успех не сопутствовал ни одной из сторон, хотя надо отдать должное пилотам противника: они очень грамотно оттянули тройку «МиГов» к Суэцкому каналу, и неизвестно чем бы все закончилось, если бы расчеты РЛС бригадного командного пункта вовремя не заметили подтягивавшиеся из глубины Синая подкрепления в виде еще одной четверки «Миражей».
Любопытно, что израильтяне, в отличие от американцев, довольно быстро разобрались в достоинствах и недостатках F-4, которым в маневренных схватках приходилось туговато. Опробовав эти машины в учебных боях с «Миражами» над пустыней Негев, израильтяне пришли к выводу, что «Фантомы» явно не могут конкурировать с «МиГами» на коротких дистанциях, проигрывая последним в разгонных характеристиках в диапазоне околозвуковых скоростей, по угловой скорости крена и времени виража. Однако наличие мощной БРЛС AN/APQ-120 с дальностью обнаружения воздушных целей до 70 км и четырех-шести УР с РЛ ГН AIM-7 «Спэрроу», позволяло теоретически использовать эти машины для поддержки «Миражей» с дальних дистанций. Фактически F-4 в израильских ВВС никогда не действовали в роли истребителя для завоевания господства в воздухе (как, например, в ВВС США). Основным способом их применения в воздушных боях стала прямолинейная атака снизу, проводимая на средней дальности, что в полной мере позволяло реализовать все имеющиеся преимущества и нивелировать недостатки. Хотя в ходе «войны на истощение» этот вариант большого распространения не получил (в основном из-за ограниченных масштабов боевых действий и невысокого качества аппаратуры идентификации цели по принципу «свой-чужой»), но в октябрьской «войне судного дня» 1973 г. он уже стал типовым.
Еще одним способом применения сверхзвуковых истребителей стало психологическое давление на население. Первыми это начали делать израильтяне, «вусмерть» замученные египетскими артналетами. С ноября 1969 г. началась операция «Шок», в рамках которой F-4 производили сверхзвуковые полёты на малой высоте над Каиром и другими египетскими городами. Результаты в отдельных рейдах были потрясающими: у людей лопались барабанные перепонки, в окнах сыпались стекла, и даже телеграфные столбы не всегда выдерживали акустический удар. В то же время никакого военного эффекта эти рейды дать не могли, но израильтяне надеялись, что население Египта потребует мира. Арабы конечно были не прочь жить в мире, но без евреев, а потому их реакция была адекватной, но, поскольку, МиГ-21 с аэродромов, расположенных восточнее дельты Нила, дотянуться до израильских городов не могли, а звуковые удары по гарнизонам противника на Синае мало что давали, к ответным акциям подобного рода были подключены ВВС Сирии. Уже 29 января 1970 г. одиночный сирийский МиГ-21 демонстративно перешёл звуковой барьер во время бреющего полета над Хайфой, что привело в шок добрую половину жителей этого города. «Ответ» командования израильских ВВС был предсказуемым: действие «шоковой терапии» распространилось и на города Сирии.