Бомбометание выполнялось с высот порядка 12 км. Самолеты подходили к цели, маневрируя по курсу. При этом они несколько раз кратковременно включая свои БРЛС, осуществлявшие картографирование местности по курсу в секторе 30°. Это позволяло экипажу более точно привязаться к местности, уточнить истинную высоту полета и местоположение цели (если она была достаточно радиолокационноконтрастна). После этого при помощи системы управления вооружением GATS летчики непосредственно перед бомбометанием вносили коррекцию в системы наведения КАБ. В результате точность бомбовых ударов боеприпасами JDAM, по утверждению представителей ВВС США, удалось повысить с 13–14 до 6 м.
Продолжительность боевого вылета В-2А составляла, в среднем, 33 ч. При этом выполнялось три-четыре дозаправки в воздухе. В ходе подготовки к операции «Союзническая сила» один из самолетов «Спирит» совершил экспериментальный беспосадочный перелет по маршруту Уайтмен-Гуам-Уайтмнен протяженностью 26600 км и продолжительностью 37 ч (средняя скорость на маршруте — 720 км/ч), а на тренажере был выполнен «беспосадочный полет» продолжительностью 44,5 ч.
Был сделан вывод, что в случае необходимости бомбардировщик сможет находиться в воздухе 50 ч. Переносить столь длительные полеты экипажу В-2А, состоящему всего из двух человек, помогал высокий уровень автоматизации, хорошо продуманная эргономика кабины, а также специальное оборудование, включающее такие «маленькие радости», как биохимический туалет, спинки катапультных кресел, оборудованные вибромассажерами, а также меню бортпайка, составленное с учетом вкусов конкретного члена экипажа. В то же время специалисты конгресса США, подготовившие доклад об использовании самолета В-2А в боевых действиях на Балканах, на основе опроса летчиков отметили, что приборное оборудование кабины этого самолета не лишено ряда недостатков, повышающих утомляемость экипажа и затрудняющих его ориентирование в боевой обстановке.
B-2A в сопровождении истребителей F-22
Следует отметить тот факт, что В-2А имели над Сербией весьма солидное авиационное прикрытие, включавшее наряд самолетов радиоэлектронной борьбы ЕА-6В и истребителей F-15C. При этом мощнейшая информационная поддержка обеспечивалась самолетами ДРЛО Е-3 и самолетами радиолокационной разведки и управления Е-8. Такая тактика противоречила основным принципам использования самолетов steals действовать в одиночку, без привлечения самолетов других типов, не обладающих свойствами малозаметности и способных демаскировать бомбардировщик. Кроме того, как минимум, на порядок возрастала цена одного боевого вылета В-2А.
Требовалась и весьма «тонкая» работа по согласованию совместных действий множества разнотипных летательных аппаратов, базировавшихся на разных континентах (Европа, Африка, Америка) и принадлежащих различным родам войск (к примеру, «хозяином» палубных самолетов ЕА-6В, прикрывавших «Спириты», являлись моряки). Это не могло сказаться на оперативности боевого применения бомбардировщиков, а также на обеспечении требуемого режима секретности. Однако американцы (особенно после потери в небе Югославии первого «малозаметного» самолета F-117), вероятно, в большей мере полагались на мощь авиационного прикрытия, а не на скрытность самого «Спирита».
В американской печати приводились кадры съемки с борта разведывательного ЛА, на которых было изображено восемь капониров на одном из аэродромов в Косово, каждый из которых после удара самолета В-2А, сбросившего восемь КАБ, имел по «черному пятну» (т. е. пробоине). На другом кадре можно было видеть бетонное укрытие на аэродроме в Приштине, разрушенное со стороны передних и задних ворот двумя попаданиями (якобы тоже работа В-2А). Однако тот факт, что большинство боевых самолетов ВВС Югославии благополучно покинуло Косово (в том числе и с аэродрома Приштина) после достижения перемирия, свидетельствовал о том, что боевые успехи «Спиритов» оказались несколько преувеличенными. Скорее всего, причины этого кроются не в недостатках собственно самолета и его комплекса вооружения, а в несоответствии возможностей ударных и разведывательных средств (как это имело место и во время «Бури в пустыне»).
К одному из весьма сомнительных «успехов» самолетов В-2А (в значительной степени обусловленному «четкой» работой разведки) следует отнести бомбовый удар по зданию китайского посольства в Белграде, нанесенный тремя КАБ JDAM.
В докладе, подготовленном по заданию конгресса США, отмечалось, что радиопоглощающие покрытия, примененные в конструкции бомбардировщика «Спирит», имеют относительно низкую износостойкость. Указывалось и на высокую трудоемкость наземного обслуживания этого самолета, проявившуюся в ходе боевых действий. Это, по мнению авторов доклада, «снижало возможности ВВС по использованию бомбардировщиков так часто, как того требовала обстановка». Подверглась критике и низкая крейсерская скорость самолета (в реальной обстановке оказавшаяся, очевидно, меньше расчетной).
Нужно сказать, что боеготовность парка бомбардировщиков В-2А к началу операции «Союзническая сила» в Югославии не превышала 30 %. Фактически после каждого вылета самолет нуждался в ремонтно-восстановительных работах по компенсации износа РПМ на отдельных участках обшивки, что занимало 39 % трудозатрат, отведенных на наземное техническое обслуживание «Спиритов».