Осенью на основании телеграммы № Г/192 начальника штаба ВВС КА от 14 октября 1941 г. готовилось перебазирование школы в Сталинград, но затем новым местом дислокации был определен г. Карши в Средней Азии. Тогда же из школы был выведен истребительный отдел, который эвакуировали в г. Аджикабул (Закавказский военный округ). С 27 июля по 15 октября 1941 г. истребительным отделом школы переучено на самолет МиГ-3 350 летчиков, сформировано и отправлено на фронт 15 истребительных авиационных полков.
Осенью 1941 г. окончательно сформулированы задачи школы, которые по большому счету, оставались неизменными на протяжении всей войны: подготовка и усовершенствование экипажей в составе летчика, штурмана и стрелка-радиста (затем добавлен еще воздушный стрелок) Дальнебомбардировочной авиации, способных выполнять одиночные полеты по маршруту днем и ночью в простых и сложных метеоусловиях, отыскивать и поражать цели, поддерживать в полете постоянный радиообмен с КП. Комплектование школы производилось из числа летного состава, освоившего самолет ДБ-3. Планом боевой подготовки определялся срок первого выпуска (досрочного) – 15 февраля 1942 г. – 20 экипажей. Затем 15 числа каждого месяца вплоть до июня включительно школа должна была выпускать по 20 экипажей, а с июня перейти на 6-месячный срок обучения и готовить по 30 экипажей.
Видимо, переименования 1-й ВВШ в Учебный центр не произошло, так как приказом Командующего ВВС № ГОКО 1339 ее от 24 февраля 1942 г. 1-я ВВШ переименована в 1-ю Высшую школу штурманов и летчиков АДД. Школа теперь напрямую подчинялась Командующему АДД, ранее – командующему ВВС военного округа. В апреле в очередной раз пересмотрели программы обучения экипажей – срок обучения 3-5 месяцев, по 50 экипажей ежемесячно. За период обучения в школе налет летчика, согласно программе, составлял 48 ч, штурмана 50 ч, стрелка-радиста – 30 ч, воздушного стрелка – 20 ч. По прежнему в состав школы входило шесть эскадрилий. Пять бомбардировочных эскадрилий имели на вооружении бомбардировщики ДБ-3. 1-я и 5-я эскадрильи базировалась в Нишане, 2-я и 4-я – в Карши, 3-я – в Ханабаде. На вооружении 6-й смешанной эскадрильи состояли самолеты ТБ-3 и ПС-84, эскадрилья базировалась в Карши. В бомбардировочной эскадрильи по штату полагалось иметь 12 самолетов ДБ-3 и три У-2. В июле 1942 г. 2-ю и 5-ю эскадрильи перебазировали в Семипалатинск.
Решением ГКО № 3190 от 15 апреля 1943 г. школе определялось новое место дислокации – аэродром Троицк, 2-я и 5-я эскадрильи оставалась в Семипалатинске. Перебазирование из Средней Азии на Урал происходило в июле-августе 1943 г., осенью на Урал перебросили эскадрильи из Семипалатинска. Эскадрильи школы базировались в Троицке, Кумысной и в Пешковской.
Ту-4 – основная учебная машина центра в 1950-х годах
На Урале школа оставалась недолго. Постановлением ГКО № ГОКО 5131 от 9 февраля 1944 г. местом дислокации определялась Рязань. Школа возвращалась домой! 6 марта 1944 г. в очередной раз изменилось наименование – 1-я Рязанская Высшая офицерская школа ночных экипажей АДД. Школа переводилась на новый штат. В ее составе формировалось четыре учебных авиационных полка на самолетах Ил-4. Командиром 1-го полка стал майор Орловский, 2-го – майор Воробьев, 3-го – майор Иванов, 4-го – майор Курышев. Помимо полков в составе школы была сформирована 9-я эскадрилья тяжелых кораблей Ли-2 (Ли2 довольно интенсивно использовались Авиацией Дальнего Действия как ночные бомбардировщики).
После реорганизации авиации дальнего действия, в наименовании школы аббревиатура АДД сменилась на ВВС КА. В мае 1944 г. были изменены номера полков: 1-й стал 21-м, 2-й – 22-м, 3-й – 23-м и 4-й – 24. 21-й полк базировался в Дягилево, 22-й – в Ряжске,
23-й – в Моршанске и 24-й в Житово.
Как уже отмечалось, главной задачей школы в годы войны являлась подготовка экипажей для АДД. В 1941 г. школы выпустила 162 летчика и 183 штурмана, в 1942 г. – 68 полноценных экипажей, 284 штурмана и 50 стрелков-радистов, в 1943 г. – 132 экипажа, 350 штурманов, 35 стрелков-радистов, 85 воздушных стрелков, в 1944 г. – 125 экипажей, 176 штурманов, 27 стрелков- радистов, 242 воздушных стрелка, в 1945 г. – 32 экипажей, 123 штурмана, 193 стрелка-радиста и 235 воздушных стрелков. Героями Советского Союза стали 20 выпускников школы. Орденами было награждено 446 выпускников школы.
В 1946 г. состав школы сократился на два полка: расформировали 23-й и 24-й учебные авиационные полки. С сентября 1 946 г. школа стала именоваться 1-я Рязанская Высшая авиационная офицерская школа Дальней Авиации, а с 4 октября 1947 г. – Рязанской Военной авиационной офицерской школой боевого применения ДА. Срок обучения в школе 1 год.
3 июля 1947 г. согласно Указа Президиума Верховного Совета СССР от 1 6 апреля 1 947 г. школе было вручено Боевое Знамя части. В том же году личный состав начал переучиваться на бомбардировщики В-25 и Ту-4.
Реорганизация 1948 г. связана с началом поступления в полки Дальней Авиации бомбардировщиков Ту-4. 21-й учебный авиационный полк был преобразован в 595-й, 22-й – в 596-й, на следующий год 595-й полк стал именоваться учебным тяжело-бомбардировочным авиационным полком. По штату полку полагалось иметь три эскадрильи бомбардировщиков Ту-4 и одну эскадрилью самолетов В-25 и Ли-2, однако переход на новый штат затянулся из-за нехватки четырехмоторных бомбардировщиков: на 1 января 1950- го в полку имелось всего три самолета Ту-4. На аналогичный 595-му полку штат 596-й полк был переведен в августе 1950 г.