В конце апреля 1859 года он простудился и слег в постель.
Смерть приближалась быстро, но не причиняя сильных страданий. Он не разрушался от внезапно нагрянувшей болезни; он угасал, как солнце, склонившееся к горизонту. Сознание сохранилось до последнего дня, но силы исчезали, дыхание становилось короче и прерывистее, дремота все более и более овладевала им и 6 мая 1859 года в 3 часа пополудни перешла в сон, от которого никто не пробуждается.
10 мая огромная и торжественная процессия направлялась от дома Гумбольдта к собору. За слугами покойного следовала депутация от студентов Берлинского университета, за ними похоронная музыка, духовенство; далее несли знаки Черного Орла и других орденов, за которыми двигалась похоронная колесница, запряженная королевскими лошадьми; за нею кавалеры Черного Орла, министры, придворные, генералитет, камергеры, депутации палаты депутатов, штаба, присутственных мест, магистрата, Академий и прочие, наконец, парадные экипажи короля, принца-регента, королевы и бесчисленная вереница других.
На паперти собора процессию встретил принц-регент и другие члены царствующего дома с обнаженными головами. Бесчисленная толпа наводнила собор и площадь перед ним. Простой дубовый гроб, украшенный венками из белых азалий, пальмовых и лавровых веток, был опущен на эстраду перед алтарем. Вечером его перевезли в Тегель и поставили в семейном склепе, рядом с останками Вильгельма Гумбольдта.
Состояния Гумбольдт не оставил. Огромная библиотека и движимое имущество были им завещаны Зейферту; рукописи, ордена, медали и прочее последний передал родным Гумбольдта.
Памятники ему поставлены во многих городах Европы; но самый долговечный из них он сам воздвиг себе своею деятельностью.
1. Klencke. A. v. Humboldt's Leben und Wirken. Vortges., erweit. und umgearb. von Kuhne und Hintze. Siebente Aufl. – 1888.
2. Wittwer. A. v. Humboldt. Sein wissenschaftliches Leben und Wirken. – 1860–1861.
3. Humboldt's Briefe an Varnhagen v. Ense.
4. Correspondance scientifeque et littéraire de Humboldt, rec. et publ. par De la Roquette.
5. Briefe von A. v. Humboldt an Bunsen. – Leipzig, 1869.
6. O. Uhle, A. v. Humboldt.
7. Лугинин. А. фон Гумбольдт.
8. С. ий. А. фон Гумбольдт («Вестник Европы», 1870, № 9, 10, 12) и некоторые другие.