Профессор химии В. В. Марковников сформулировал принцип «химического равновесия», который в обобщенном виде устанавливал зависимость равновесия внутримолекулярного влияния атомов от внешних физических и химических условий.
1903. Профессор университета С. А. Чаплыгин в своей докторской диссертации «О газовых струях» предложил метод, позволяющий решать задачи скоростной авиации.
Профессор физиологии И. М. Сеченов публикует итоговый труд «Элементы мысли».
Открытие Физического института Московского университета, который стал одним из центров разработки важнейших научных проблем.
Открытие при университете первой в России онкологической клиники, руководимой профессором Л. Л. Левшиным.
1904. Магистрант университета Н. А. Шилов разрабатывает учение о сопряженных реакциях окисления.
1905. 7–9 сентября. Студенческая сходка в университете с участием свыше 4 тысяч человек. Оценивая эту сходку и ее резолюцию, В. И. Ленин писал: «Резолюция эта по-настоящему, языком свободных граждан, а не пресмыкающихся чиновников, клеймит Государственную думу, как наглую издевку над народом, призывает к борьбе за республику, за созыв временным революционным правительством действительно всенародного и действенно учредительного собрания» (В. И. Ленин. ПСС, т. 11, стр. 346).
В университете впервые организована студенческая бригада. У входов в университет студенты возвели баррикады. Участие студентов в декабрьском вооруженном восстании.
Профессор университета физик Н. А. Умов разработал метод качественного! спектрального анализа цветных тел. Это исследование получило практическое применение в исследовании минералов.
Митинг рабочих и студентов во дворе университета. Осень 1905 года.
1906. Профессор университета Н. Е. Жуковский в труде «О присоединенных вихрях» разработал теорию подъемной силы крыла самолета, заложив основы аэродинамики.
Разрешено женщинам на правах сторонних слушателей посещать лекции в университете. Одной из первых на юридический факультет поступает И. Ф. Арманд.
1908. Под руководством профессора зоологии Г. А. Кожевникова организована близ Москвы Косинская лимнологическая станция университета. В Москве открыты. Высшие сельскохозяйственные курсы, созданные и руководимые профессором университета Д. Н. Прянишниковым.
1908–1910. Профессор В. И. Вернадский своими исследованиями вносит вклад в изучение процессов минералообразования и создает новую науку — геохимию.
1909. При Московском университете и Московском высшем техническом училище учреждается Общество содействия успехам опытных наук и их практических применений.
Оставленный при университетской кафедре геоботаники для подготовки к профессорскому званию В. В. Алехин своей первой работой «Очерк растительности и ее последовательной смены на Стрелецкой степи под Курском» заложил основу нового направления университетской геоботаники— изучение полей.
Создание профессором В. И. Вернадским радиевой комиссии с целью исследования месторождений радиоактивных минералов и изучения геохимии радиоактивных элементов.
1909–1917. Профессор астрономии Московского университета П. К. Штернберг организует гравиметрическое (по измерению силы тяжести) изучение на территориях России.
1910. Студенческий митинг в Аудиторном корпусе университета принял решение об участии в общестуденческих демонстрациях по поводу смерти Л. Н. Толстого. В организации демонстрации участвовали студенты-большевики во главе с секретарем большевистской фракции В. Ф. Мясниковым. В это время в университете учились студенты-большевики Г. А. Атарбеков У. Д. Буйнакский, М. И. Рогов, Г. Н. Корганов, С. Г. Осепян, С. Г. Шаумян.
1911. Около 400 профессоров и сотрудников университета подали в отставку в знак протеста против реакционной политики правительства в отношении университета. В числе ушедших из университета были профессора — К. А. Тимирязев, П. Н. Лебедев, В. И. Вернадский, Н. А. Умов, Н. Д. Зелинский, С. А. Чаплыгин, П. П Лазарев, Н. К. Кольцов, А. П. Павлов и др.
1911–1917. Работа профессора математики Д. Ф. Егорова послужила исходной точкой работ по теории функций действительного переменного. Возникновение московской школы теории функций.
1912. При Московском университете открыт Музей изящных искусств (ныне Государственный музей изобразительных искусств имени А. С Пушкина) по инициативе профессора университета И. В. Цветаева. Профессор университета зоолог А. Н. Северцов открыл новое направление в биологии — эволюционную морфологию. Основная теоретическая разработка этого направления отражена в его книге «Этюды по истории эволюции». Начало чтения профессором Н. Ю. Зографом в университете курса «Экспериментальной зоологии», положившего начало преподаванию генетики.
1913. Создание географом, приват-доцентом университета А. А. Борзовым теории формирования асимметрии долин и междуречий (так называемое «правило Борзова»).
Учреждение при Гигиеническом институте университета отделения «лучевого лечения».
1914. По предложению профессора Д. Н. Анучина журнал «Землеведение» выступил с инициативой создания в России заповедников и охраны памятников природы.