Влиянию британских традиций, пожалуй, наиболее сильно были подвержены пакистанские летчики, считавшиеся элитой, которой позволялось пренебрегать многими нормами общественного поведения, принятыми в исламской стране. Наиболее ярко это проявилось в том, что на пакистанских авиабазах потребление спиртного было обычным делом и нисколько не преследовалось. Игнорируя заповеди Корана, персонал PAF с энтузиазмом устраивал бары в офицерских клубах на каждой авиабазе. Чтобы стать пилотом, Аламу, закончившему лётную школу в Дакке в 1954 г., пришлось перенять опыт потребления спиртного у своего брата, тоже офицера, а затем практиковаться при каждом удобном случае. Другой традицией, пришедшей в PAF из RAF, были непременные прозвища, получаемые каждым пилотом в боевой чэсти. Прозвище Алама из-за его небольшого роста было «Пинат» (Peanut – арахис, земляной орех). Мохаммад с уважением относился к традициям, но все же с большим энтузиазмом занимался повышением уровня своего профессионализма. На стрельбах он обычно до 70% пуль укладывал в цель – это был высший показатель среди пакистанских пилотов.
Первой боевой частью, в которую получил назначение Алам, была 11-я эскадрилья, первой в пакистанских ВВС получившей на вооружений в 1951 г. реактивные «Аттакеры». На протяжении следующих четырех лет она так и осталась единственной реактивной. Эта ситуация изменилась лишь в 1955 п, когда США начали поставки в Пакистан «Сейбров», а в 11-ю эскадрилью F-86F начали поступать в 1956 г Нехватка достаточного количества опытных офицеров среднего звена вынуждала командование выдвигать на руководящие посты молодых подающих надежды пилотов, и в феврале 1964 г. Алам возглавил 11-ю эскадрилью. Его предшественник – Мухаммад Анвар Шамим (Muhammad Anwar Schamim), стал командиром 33-го авиакрыла. Спустя примерно год, в 1965-м, 11 -я эскадрилья вошла в состав этого соединения, расквартированного в местечке Саргодха (Восточный Пакистан).
Между тем, в начале 1965 г. тучи войны стали сгущаться над Кашмиром. К сентябрю этого года напет Алама на истребителе F-86F составил 1400 часов, и к этому надо прибавить некоторую практику полетов на «Хантере», которую он получил будучи на стажировке в Великобритании. Как показали последовавшие вскоре события, опыт знакомства с основным индийским истребителем ему очень пригодился. Тем временем в Ранн оф Кутч, на берегу Аравийского моря, произошло несколько пограничных инцидентов с применением оружия, которые и стали формальным поводом к началу военных действий между Индией и Пакистаном. В течение нескольких месяцев Пакистан набрал, обучил и вооружил партизанскую «Армию Свободного Кашмира», бойцов которой называли моджахедами (mujaheddin). В ответ на это индийские войска 15 августа заняли стратегически важный регион Каргил (Kargil). Эскалация напряженности привела к тому, что противоборствующие стороны перешли к открытым военным действия с применением всех родов войск.
Армии двух стран были примерно равны 8 количестве и оснащении, но Индия, имевшая в начале конфликта 476 истребителей и 60 бомбардировщиков, имела подавляющее превосходство над Пакистаном с его 104 истребителями и 26 бомберами. К началу боевых действий 33-е авиакрыло имело всего 30 «Сейбров», 22 из которых, помимо шести 12,7-мм пулеметов «Кольт-Браунинг», были вооружены парой управляемых ракет с ИК ГСН AIM-9B «Сайдуиндер». С самого начала было совершенно ясно, что только высокая интенсивность применения авиации и разнообразные тактические «хитрости» позволят пакистанским летчикам хоть как- то противостоять индусам.
Для сквадрон лидера Алама война началась 2 сентября в 05:30 утра, когда он вылетел во главе семерки истребителей для нанесения удара по наземным частям индийцев в районе Джауриан. Поначалу пакистанцы ничего не заметили и, уж было, собрались возвращаться, когда Алам увидел пехотинцев, прячущихся во фруктовом саду. После первой же атаки с земли открыла огонь зенитная артиллерия, а замаскированные танки, бронемашины и грузовики пришли в движение. Всего, по докладам пакистанских пилотов, уничтожено пять танков, грузовик и много живой силы.
На следующий день Алам вылетел на разведку индийского аэродрома в Джамму. Для обеспечения скрытности, лететь пришлось на малой высоте, где его «Сейбр» едва не стал жертвой вражеских зенитчиков. Меткая очередь с земли вдребезги разнесла остекление кабины, осколки которого разбили и стекло гермошлема. Полуослепший от осколков плексигласа и бьющего с невероятной силой в лицо встречного потока воздуха, Алам, тем не менее, сумел сохранить управление машиной и, заметив, откуда велась стрельба, решил не оставаться в долгу. Это был опрометчивый поступок, едва не стоивший ему жизни. Индийские расчеты увидели заходящий на штурмовку одинокий «Сейбр» и открыли сосредоточенный огонь. Лишь очень высокая скорость, большое угловое перемещение и малая площадь цели помешали им сбить истребитель с зеленым исламским флажком на киле. Тем не менее, F-86F получил новые повреждения, но до того как вражеские пули разбили систему электроспуска оружия и пулеметы смолкли, пакистанец успел всадить две длинные очереди в позиции зенитчиков.