Весной 1940 г. вермахт интенсивно готовился к операции «Везерюбунг» — оккупации Дании и Норвегии. На стадии подготовки к ней, 8 марта, «Кондор» из «команды Ровеля» совершил разведывательный полет в район Нарвика и привез ценные фотоснимки. А для обеспечения десантной операции пришлось вновь мобилизовать самолеты «Люфтганзы».
FW 200А свели в отряд 4./KG z.b.V. 107, командиром которого назначили обер- лейтенанта Альфреда Хенке — того самого, который на гражданке пилотировал «Кондор» в рекордных полетах Берлин- Нью-Йорк и Берлин-Токио. Нужда в транспортных самолетах была столь острой, что помимо трех гражданских FW 200 в отряд передали и две машины, ранее переоборудованные в фоторазведчики.
FW 200А-0 «Абаитара» бразильской авиакомпании «Синдикате Кондор»
FW 200D-2 «Рейнланд» стал одним из первых мобилизованных «Кондоров»
Кабины пилотов гражданского FW 200А и военного FW 20 °C-1
В первый день операции, 9 апреля 1940 г., «Кондоры» перевозили личный состав 324-го пехотного полка из Ноймюнстера в Осло, а на следующий день доставляли туда же боеприпасы. С 13 апреля FW 200 действовали уже из захваченного Осло, снабжая горных егерей в Нарвике. При этом грузы в контейнерах сбрасывались на парашютах. Бывшие фоторазведчики оказались лучше приспособленными для этой цели — после демонтажа аэрофотоаппаратов остались люки в полу, через которые сбрасывать контейнеры было гораздо удобнее, чем через боковые двери. Другие «Кондоры» отряда в экстренном порядке также были оборудованы подобными люками. Работы выполнили мастерские «Люфтганзы» на берлинском аэродроме Штаакен.
11 апреля 1940 г., сразу после начала норвежской кампании, люфтваффе конфисковали два FW 200КВ-1, строившихся по финскому заказу. Однако в состав транспортной авиации эти машины вошли только в июне. Они были достроены в варианте FW 200D-1, отличавшемся рядом особенностей, в частности, устройством для буксировки десантных планеров.
Осенью 1940 г. возобновились поставки «Кондоров» для «Люфтганзы», получившей три самолета модификации FW 200D-2. Первый из них — D-AWSK «Рейнланд» — был передан 11 сентября и впоследствии использовался для обеспечения работы комиссии по перемирию с Францией. В частности, он совершал рейсы в Северную и Западную Африку, возвращая на родину интернированных там немецких граждан. Две другие машины — D-ACWG и D-AMHL — передали заказчику в октябре. Им достались названия «Гольштейн» и «Поммерн», освободившиеся год назад после передачи двух самолетов в Бразилию.
Несмотря на войну, конструкторы «Фокке-Вульфа» продолжали разработку более совершенных гражданских вариантов «Кондора». Модификация под обозначением FW 200L-1, должна была получить моторы Bramo 323R-2 Fafnir (1000 л.с.), новое шасси и другие усовершенствования. Однако прототип этого варианта FW 200V14 достроить так и не удалось — все усилия были обращены на военные модификации.
В феврале 1941 г. «Кондоры», еще остававшиеся у «Люфтганзы», окончательно забрали люфтваффе. Большинство их попало в запасной отряд эскадры KG 40, дислоцировавшийся в Люнебурге. В 1943-44 гг. самолеты «Поммерн» и «Фрисланд» вернули авиакомпании для службы на линиях, связывавших Германию с Испанией и Скандинавией. Вечером 27 сентября 1944 г. «Поммерн» был сбит американским ночным истребителем у Дижона (Франция) во время очередного рейса в Испанию. Трое членов экипажа и пять пассажиров погибли. А 29 ноября был потерян и «Фрисланд», упавший в море в 9 км от берега в ходе полета в Швецию.
Передняя и задняя верхние стрелковые установки с пулеметами MG 131. Справа — бортовая установка с пулеметом MG 15
Нижние стрелковые установки: передние с пушками MG FF и MG 151/20, задняя с пулеметом MG 15
Основная опора шасси самолетов FW 200А-0 и FW 20 °C
«Каперский самолет»
1 августа 1939 г. в составе люфтваффе создали новое объединение — 10-й авиакорпус, задачей которого в предстоящей войне должны были стать операции против британского флота и судоходства. Однако находившиеся на вооружении двухмоторные бомбардировщики (не говоря уж об одномоторных «штуках») имели ограниченный боевой радиус, не позволявший действовать на океанских коммуникациях. Поэтому 5 сентября 1939 г. один из офицеров штаба 10-го корпуса гауптман Эдгар Петерсен (Edgar Petersen) прибыл в Бремен с целью выяснить возможность переделки находившихся в постройке планеров гражданских FW 200В в «каперские самолеты» (Kaperflugzeuge). Уже из самого термина было понятно, что в первую очередь целью «Кондоров» должны были стать не соединения Королевского флота, а торговые суда, следовавшие океанскими маршрутами.
Петерсен осмотрел сборочную линию, переговорил с инженерами предприятия и сделал вывод, что переоборудование самолетов может быть произведено в течение восьми недель после получения соответствующего указания. Из Бремена он отправился в штаб 2-го воздушного флота (которому подчинялся 10-й авиакорпус), где предложил все строившиеся FW 200В, начиная со второго экземпляра, переделать в разведывательно-ударный вариант и передать 10-му авиакорпусу. Предложение было одобрено, и после согласования с фирмой-производителем генерал-флюгцойгмейстер люфтваффе Ганс Ешоннек (Hans Jeschonnek) 18 сентября 1939 г. дал указание внести в план поставок люфтваффе коррективы, предусмотрев поставку 20 боевых FW 20 °C в период с ноября 1939 по август 1940 гг.