В частности, было решено сократить состав экипажа путем отказа от бортинженера. Частично его функции решено передать автоматике, остальное распределить между командиром воздушного судна и вторым пилотом. Применены новые широкоформатные дисплеи с лучшим качеством изображения, установлены вновь разработанное пилотажно-навигационное оборудование на базе ВСС-100 самолета Ан-148, а также объединенный комплекс управления полетом и тягой двигателей. Для упрощения управления самолетом впервые применен так называемый «трек-бол», с помощью которого можно легко управлять радиосвязью, изменением маршрута и другими важными функциями.
Серьезное внимание в ходе разработки Ту-204СМ было обращено на обеспечение ресурса планера, который составляет: 60 тысяч летных часов, 30 тысяч полетов, 25 календарных лет. Эти цифры хоть и не особенно впечатляют, но являются вполне приемлемыми и, к тому же, наверняка имеют перспективу дальнейшего увеличения. Многие из бортовых систем станут цифровыми, и «болезни», которыми «страдали» их аналоговые предшественники, уйдут в прошлое. В первую очередь это относится к системе кондиционирования воздуха. Теперь она будет иметь три независимые зоны регулирования, что полностью снимет вопросы, которые возникают сегодня у авиакомпаний насчет неравномерности воздушных потоков и поля температур подлине пассажирской кабины. В отличие от предшественника, на Ту-204СМ закрылки отклоняются не гидравлической системой, а электрической. Модернизации будет подвергнуто также шасси, нововведения в котором пойдут в серию с шестого самолета.
Важнейшим элементом модернизации базового самолета является применение нового двигателя ПС-90А2 взамен ранее устанавливаемого ПС-90А, что должно придать Ту-204СМ еще большую привлекательность для авиаперевозчиков. Во- первых, расширится диапазон температур окружающего воздуха на аэродроме — до +50 °C. Во-вторых, на 2000 м возрастет высота расположения самого аэродрома. Следующим эксплуатационным преимуществом станет снижение уровня шума на местности на 10–12 дБ — такие результаты конструкторы надеются получить по итогам шумовых испытаний Ту-204СМ. Но главное — увеличение наработки на выключение ПС-90А2 в полете по сравнению с ПС-90А более, чем в 3 раза. А средней наработки на съем двигателя с крыла — более, чем на четверть. Уменьшение времени на техническое обслуживание силовой установки — более, чем двухкратное. Все это достигается за счет применения ряда новых технологий, в частности, литья из современных безуглеродистых сплавов. На модернизированном двигателе установлена практически новая турбина высокого давления, с лопатками принципиально иной конструкции. Не менее важно и то, что система послепродажного обслуживания ПС-90А2 будет самой комфортной среди всех двигателей российского производства, соответствующей современным международным требованиям. В итоге, хотя ПС-90А2 будет стоить дороже ПС-90А, но стоимость полного жизненного цикла нового двигателя должна быть в 2 раза ниже, чем у предшественника.
На самолете планируется применить также новую вспомогательную силовую установку ТА-18-200М с назначенным ресурсом более, чем в 3 раза превышающим таковой у предшественницы, наряду с повышением высотности запуска, уменьшением расхода топлива и улучшением весовых параметров.
Главное, что вызывает сегодня обеспокоенность эксплуатантов самолетов семейства, — непрекращающийся поток отказов бортового оборудования. Поэтому на Ту-204СМ предполагается качественно улучшить систему поддержания уровня его надежности. Впервые в своей практике «Туполев» разработал единые требования на вновь создаваемые покупные изделия (ПКИ). Это была весьма сложная задача, решение которой потребовало год времени и массу усилий. Затяжные «бои местного значения» шли со многими поставщиками ПКИ. Но, в конце концов, единые требования были согласованы и подписаны, в настоящее время они уже реализуются поставщиками. В основе лежит простая идея. Сегодня ресурсы комплектующих изделий от системы к системе разнятся. А начиная с Ту-204СМ, все показатели сведены в единую норму. Установлено, что теперь они будут одинаковыми и привязанными к требованиям, предъявляемым к самолету в целом. В частности, минимальный гарантийный срок для ПКИ определен в 36 месяцев с момента ввода в эксплуатацию (раньше эта цифра была в 3 раза меньше). Безусловно, все это позволит значительно повысить конкурентоспособность как комплектующих изделий, так и самолета в целом.
Надо сказать, что «техническое лицо» Ту-204СМ долго оставалось размытым. Причиной многочисленных изменений, вносимых в проект по ходу его реализации, явилась неоднократная смена стартовых заказчиков самолета. Сначала в этом качестве пожелала выступить иранская авиакомпания Iran Air Tour — подразделение национального перевозчика Iran Air. Правительство Исламской Республики согласилось открыть финансирование сделки на приобретение пяти машин с последующим доведением общего заказа до двадцати, а затем — ста, при условии организации их лицензионной сборки на заводе HESA в Исфахане. Соответствующая программа известна как Iran Russia Tupolev Purchase (IRTP).