Но брат, бывший всего на два года старше, не имел на Жаклин того влияния, что отец. Она ушла из дома, направив брату письмо : «Если вы не имеете сил последовать за мной, по крайней мере, не удерживайте меня. Не разрушайте того, что построено».
Блезу оставалось только смириться. Более того – по настоянию Жаклин он передал Пор-Роялю значительную часть семейного состояния, хотя тут даже Анжелика Арно считала, то это уже чересчур.
Последующие годы относятся скорее к биографии Блеза Паскаля, чем Жаклин. Он постоянно навещал сестру в монастыре, по всей вероятности, она сыграла большую роль в превращении математика в религиозного философа.
А потом начались гонения на янсенистов. Власти потребовали от всех духовных лиц в королевстве подписать формуляр, осуждающий учения Янсения. Блез считал, что нужно идти на разумный компормисс, и подписать документ. Жаклин была категорически против. Получило распространение ее письмо по этому поводу. «Я знаю, что не дело женщин отстаивать истину. Но, если мы живем в печальные времена, когда епископы выказывают женскую робость, женщинам следует обрести храбрость епископов.»
Однако – под влиянием брата, или по какой-то иной причине, она подписала формуляр. Это ее и убило. Терзаемая муками совести, два месяца спустя Жаклин Паскаль скончалась в возрасте тридцати пяти лет. Жильберта оплакивала ее. А Блез, уверенный, что Жаклин пребывает в раю, осуждал сестру за ее скорбь.