Эволюционная патология [заметки]

1

Здесь и далее в подобных сокращениях: прописные буквы — белок, строчные — ген.

2

Из книги Тарантул В.З., 2003.

3

Повторяющаяся ДНК (repetitive DNA) в геноме человека включает гены, которые кодируют компоненты рибосом, организованные как тандемные повторы, повторяющиеся по 150–200 раз. Подобным же образом организована высокоповторяющаяся ДНК (highly repetitive DNA), включающая очень короткие последовательности, которые могут повторяться миллионы раз, — это так называемая минисателлитная ДНК (minisatellite DNA). Она включает блоки длиной по 10—100 пар оснований (bp), характерные для каждого индивидуума (в данной работе не рассматриваются).

4

По P. Medstrand, L. N. van de Lagemaat, D. L. Mager (2002).

5

По J. F. Hughes и J. M. Coffin (2005); недавно в геноме человека было идентифицировано новое семейство эндогенных ретровирусов — см. работу N. Polavarapu et al. (2006).

6

По P. Jern et al. (2006).

7

* интактные гены.

8

По Bannert N., Kurth R., 2004.

9

* — описана межвидовая передача SIV-sm (у приматов, содержащихся в неволе).

10

По Harb O. et al., 2000.

11

По G. Greub и R. Didier (2004).

12

По Chensue S. W., 2001.

13

Ч = человеческие; М = мышиные.

14

По В.Г. Галактионову (2005).

15

С сайта: http://humbio.ru/humbio/molevol/000fda4a.htm

16

Такое название таблице дал ее составитель — McFadden G., 2004.

17

ВНО представлен двумя разновидностями: O. variola var. major — собственно возбудитель натуральной оспы, смертность во время последних вспышек до 30 % от числа заболевших; и O. variola var. minor — возбудитель аластрима, доброкачественной формы оспы человека в странах Южной Америки и Африки, смертность не более 0,4 %. GM-CSF (granulocyte — macrophage colony stimulating factor) — гранулоцит-макрофаг колониестимулирущий фактор; dsRNA (double-stranded RNA — двуцепочечная РНК; TLR — Toll-подобный рецептор; SPICE (smallpox inhibitor of complement enzymes) — ингибитор ферментов комплемента ВНО; EGF-R (epidermal growth factor receptor) — рецептор эпидермального фактора роста.

18

За основу взята работа Э. Макфарланда (2006).

19

По P. Nara et al. (1991).

20

По А. Я. Лысенко с соавт. (1996).

21

По Wahl S. et al., (2006).

22

* Предсказано на основе аналогии с Т-клетками.

23

По К. Г. Васильеву и А. Е. Сегалу (1960).

24

Обобщено по данным Г. Гезера (1866), Н. А. Протасова (1891) и Г. Ф. Вогралика (1935).

25

По А. Hill (1999).

26

Для ВИЧ более подробно аналогичная информация приведена в разд. 4.2.3.

27

По Минху Г. Н., 1898.

28

По S. Marquet, E. Schurr (2001).

29

По М. В. Супотницкому (2008).

30

По Л. Бразолю (1875) и В. Губерту (1896).

31

Большая медицинская энциклопедия, 1932, т. 23.

32

По P. Singh et al. (2008); HHC, HHЕ — эволюционно различающиеся гаплотипы CCR5 (более подробно о гаплотипах CCR5 см. в работе Gonzalez E. et al., 1999).

33

По R. Massung et al. (1995).

34

За основу взята таблица из работы E. M. Ostertag, H. Kazazian (2001).

35

В большинстве (13 из 14) вставочные элементы относятся к семейству Та (см. разд. 1.2 и рис. 8).

36

Так как рассечение L1-транскрипта в полиА-сайте часто не удается, последовательность, фланкированная L1 3’-концами, может быть сдвинута вдоль участка ретротранспозиционного акта, т. е. происходит транскрипция как бы нового гена. Такая последовательность называется трансдуцированной (transduced sequences).

37

За основу взята таблица из работы E. M. Ostertag, H. Kazazian (2001).

38

Hereditary desmoid disease.

39

Multiple endocrine neoplasia type 1.