Вирусы: Скорее друзья, чем враги - [179]

Шрифт
Интервал

полимеразная цепная реакция, высокочувствительный метод амплификации молекул ДНК, который может использоваться в диагностике для выявления нуклеиновых кислот, включая мутации. Метод позволяет выполнять количественную оценку ДНК; процедура осуществляется в термоциклере, то есть в аппарате, где ДНК-содержащий образец сначала «расплавляется» и становится одноцепочечным, а затем копируется при помощи фермента ДНК-полимеразы, чтобы из каждой цепочки получить две (для этого используется стартер/праймер). Расплавление и копирование повторяются 20–60 раз, и число копий увеличивается в геометрической прогрессии (1, 2, 4, 8, 16 и т.д.). Количественная реакция, включающая предварительную обратную транскрипцию РНК в ДНК, например для выявления РНК ВИЧ, называется количественной ПЦР в реальном времени. Этот метод анализа используется очень часто. Резистентная к теплу ДНК-полимераза – это Taq-полимераза, при этом Taq в названии означает бактерию , и ее использование повысило эффективность ПЦР.

 Амеба () – 700 млрд пар оснований (bp или по); вороний глаз японский  – 150 млрд bp; тюльпан и кукуруза – 30 млрд bp; человек – 3,2 млрд bp; грибы, морские водоросли, черви – 50 млн bp; простейшие – 10–100 млн bp; бактерии – 1–10 млн bp; археи – около 6 млн bp; гигантские бактерии – 0,5–2,5 млн bp;  – 1 млн bp;  – 0,5 млн bp;  – одна из самых мелких живых клеток с 580 000 bp; вирус оспы – 350 000 bp; вирус герпеса – 100 000 bp; вирус гриппа и ретровирус – 10 000 bp; полиовирус – 7500 bp; вироиды – 300 bp.

клетки с неконтролируемым и неограниченным во времени ростом, что обусловлено генотоксическими явлениями, вызванными комбинацией большого числа факторов среды, к которым относятся радиоактивность, действие токсинов, онкогенов и некоторых вирусов, наследуемые генетические дефекты, мультифазовые или мультифакторные эффекты, активация генов рака или потеря генов – супрессоров опухолей. Раковые клетки могут иметь 18 интронов (в норме средний показатель составляет 5–7 интронов), что обусловливает высокую сложность процесса, и способны развиваться в течение более 30 лет.

часто малые некодирующие нкРНК, регулирующие гены путем активации метилтрансфераз, которые присоединяют метиловые группы к ДНК или ацетилируют хромосомы, изменяют генную экспрессию, что часто обусловлено факторами среды, приводящими к эпигенетическим эффектам, имеющим временный эффект и сохраняющимся в течение жизни только одного поколения организма; следующим поколением обычно не наследуются; впервые явление было описано Барбарой Макклинток на примере разноцветных кукурузных зерен.

  – белок одного вида, продуцируемый с использованием генной технологии в другом организме, обозначается  (р); этот метод применяется для получения новых препаратов, используется для разработки новых культур растений, регулируемых законодательством по генетически модифицированным организмам (ГМО).

 – природный механизм, предусматривающий формирование новых комбинаций ДНК (также и в лабораторных условиях); комбинация ДНК-фрагментов путем этого процесса называется клонированием.

РНК-содержащий вирус с двумя идентичными вирусными «плюс»-цепями РНК; реплицируется при помощи обязательной промежуточной ДНК; ДНК-провирус, который обычно интегрируется в геномную ДНК хозяина, кодирует примерно 10 генов, gag (для структуры), pol (для репликации с использованием ОТ, РНКазы Н, интегразы и протеазы) и env (для оболочечных белков) и несколько вспомогательных генов для регуляции репликации, главным образом у ВИЧ; он может захватывать клеточные гены, которые трансдуцируются вирусом, выступающим в роли онкогена, в другие клетки, что составляет основу исследований рака; им можно манипулировать путем захвата терапевтических генов как основы генной терапии; вирус имеет сильные промоторы, длинные концевые повторы (LTR-последовательности) для активации вирусных, а также соседних клеточных генов.

 – подвижные генетические элементы, или «прыгающие» гены, которые действуют по принципу «копировать и вставить», предусматривающему цикл обратной транскрипции; родственны безоболочечным ретровирусам, которые не покидают клетку, что приводит к дупликации генов; важный этап эволюции клеточных геномов; кодируют ОТ, РНКазу Н, интегразу, протеазы, ограничиваются LTR-последовательностями; составляют 8% генома человека, соответствующие 450 000 копий, представлены эндогенным ретровирусом человека (HERV) и ретротранспозонами; ретротранспозоны без env редко отмечаются в геноме человека, но их очень много в геномах растений и насекомых; зачастую у них креативные названия: в частности, ретротраспозоны мухи дрозофилы называются  («Цыган») или  («Облик»), а дрожжей Ty3 (или Ty1–Ty5) –  («Спящая красавица») или  («Моряк») у рыб, («Лотос») у растений, Tn у бактерий; ДНК-транспозоны и ретротранспозоны являются так называемыми «эгоистичными генетическими элементами», или «прыгающими» генами, которые нужно «приручать» или контролировать путем сайленсинга, для чего задействуется механизм siРНК, который предусматривает использование молекулярных «ножниц» для их расщепления; специальный контроль ТЭ в зародышевых клетках осуществляется за счет использования piРНК (PIWI-взаимодействующей РНК). Число ретротранспозонов может быть высоким, например 150 000–250 000 в геноме кукурузы.


Рекомендуем почитать
На траверзе — Дакар

Послевоенные годы знаменуются решительным наступлением нашего морского рыболовства на открытые, ранее не охваченные промыслом районы Мирового океана. Одним из таких районов стала тропическая Атлантика, прилегающая к берегам Северо-западной Африки, где советские рыбаки в 1958 году впервые подняли свои вымпелы и с успехом приступили к новому для них промыслу замечательной деликатесной рыбы сардины. Но это было не простым делом и потребовало не только напряженного труда рыбаков, но и больших исследований ученых-специалистов.


Историческое образование, наука и историки сибирской периферии в годы сталинизма

Настоящая монография посвящена изучению системы исторического образования и исторической науки в рамках сибирского научно-образовательного комплекса второй половины 1920-х – первой половины 1950-х гг. Период сталинизма в истории нашей страны характеризуется определенной дихотомией. С одной стороны, это время диктатуры коммунистической партии во всех сферах жизни советского общества, политических репрессий и идеологических кампаний. С другой стороны, именно в эти годы были заложены базовые институциональные основы развития исторического образования, исторической науки, принципов взаимоотношения исторического сообщества с государством, которые определили это развитие на десятилетия вперед, в том числе сохранившись во многих чертах и до сегодняшнего времени.


Интеллигенция в поисках идентичности. Достоевский – Толстой

Монография посвящена проблеме самоидентификации русской интеллигенции, рассмотренной в историко-философском и историко-культурном срезах. Логически текст состоит из двух частей. В первой рассмотрено становление интеллигенции, начиная с XVIII века и по сегодняшний день, дана проблематизация важнейших тем и идей; вторая раскрывает своеобразную интеллектуальную, духовную, жизненную оппозицию Ф. М. Достоевского и Л. Н. Толстого по отношению к истории, статусу и судьбе русской интеллигенции. Оба писателя, будучи людьми диаметрально противоположных мировоззренческих взглядов, оказались “versus” интеллигентских приемов мышления, идеологии, базовых ценностей и моделей поведения.


Князь Евгений Николаевич Трубецкой – философ, богослов, христианин

Монография протоиерея Георгия Митрофанова, известного историка, доктора богословия, кандидата философских наук, заведующего кафедрой церковной истории Санкт-Петербургской духовной академии, написана на основе кандидатской диссертации автора «Творчество Е. Н. Трубецкого как опыт философского обоснования религиозного мировоззрения» (2008) и посвящена творчеству в области религиозной философии выдающегося отечественного мыслителя князя Евгения Николаевича Трубецкого (1863-1920). В монографии показано, что Е.


Технологии против Человека. Как мы будем жить, любить и думать в следующие 50 лет?

Эксперты пророчат, что следующие 50 лет будут определяться взаимоотношениями людей и технологий. Грядущие изобретения, несомненно, изменят нашу жизнь, вопрос состоит в том, до какой степени? Чего мы ждем от новых технологий и что хотим получить с их помощью? Как они изменят сферу медиа, экономику, здравоохранение, образование и нашу повседневную жизнь в целом? Ричард Уотсон призывает задуматься о современном обществе и представить, какой мир мы хотим создать в будущем. Он доступно и интересно исследует возможное влияние технологий на все сферы нашей жизни.


Лес. Как устроена лесная экосистема

Что такое, в сущности, лес, откуда у людей с ним такая тесная связь? Для человека это не просто источник сырья или зеленый фитнес-центр – лес может стать местом духовных исканий, служить исцелению и просвещению. Биолог, эколог и журналист Адриане Лохнер рассматривает лес с культурно-исторической и с научной точек зрения. Вы узнаете, как устроена лесная экосистема, познакомитесь с различными типами леса, характеризующимися по составу видов деревьев и по условиям окружающей среды, а также с видами лесопользования и с некоторыми аспектами охраны лесов. «Когда видишь зеленые вершины холмов, которые волнами катятся до горизонта, вдруг охватывает оптимизм.