Компьютерра, 2006 № 03 (623) - [9]
«Нести Моцарта в массы» библиотекарям помогает фирменный веб-сервис Turning the Pages («Переворачивая страницы», www.bl.uk/onlinegallery/ttp/ttpbooks.html), сработанный на Macro-media Shockwave. Развороты отсканированы с такой четкостью (благодаря применению «лупы» различима даже текстура пергаментной бумаги), что у посетителя и впрямь складывается ощущение, будто он держит в руках бесценную рукопись.
Моцартовский проект стал для британских книжников уже пятнадцатым по счету: ныне с их легкой руки интернетчики уже могут «пошуршать страницами» альбома эскизов Леонардо да Винчи, анатомического атласа Андрея Везалия и черновиков кэрролловской «Алисы в стране чудес». Увы, все идет к тому, что растущий как на дрожжах виртуальный зал манускриптов застопорится на XX веке: современные «моцарты», предпочитающие творить при помощи «электронных перьев», не слишком заботятся о том, чтобы обеспечить работой архивариусов. — Д.К.
9 января закрылся один из крупных проектов распределенных вычислений — Find-a-Drug.org, который был создан в апреле 2002 года для компьютерного моделирования новых лекарств.
За прошедшие почти четыре года он так и не стал лидером среди систем распределенных вычислений по числу участников (в рекордсменах ходят SETI@home со своим поиском радиосигналов инопланетян, и Grid.org, моделирующий лекарства от рака). Тем не менее FaD удалось привлечь достаточное количество энтузиастов, чтобы несколько лет обсчитывать серьезные задачи.
Напомним, что суть компьютерного поиска новых лекарств состоит (упрощенно) в следующем. Ученые-медики составляют список «мишеней», которые нужно поразить. Как правило, это белки, чьи молекулы очень велики и имеют сложную трехмерную структуру. Ученые знают, что эти белки играют ключевую роль в заболевании, и предполагают, что если к ним присоединить другую молекулу, их свойства изменятся и развитие болезни в организме остановится. Далее берется огромная библиотека моделей химических веществ-кандидатов и моделируется их взаимодействие с белком-мишенью. Специальные алгоритмы оценивают, насколько прочно молекулы могут соединяться с мишенями, и если этот показатель достаточно велик, значит, реакция возможна и в реальном мире.
Подобное моделирование можно вести с разной точностью, но в любом случае оно требует гигантских вычислительных ресурсов. Find-a-Drug использовал в своей работе симуляционный алгоритм THINK, аналогичный проекту GRID.org, но оптимизированный под свои задачи. В разное время просчитывались белки, участвующие в развитии малярии, СПИДа, рассеянного склероза, некоторых форм рака, болезни Кройцфельда-Якоба (коровьего бешенства) и атипичной пневмонии.
Всего в проекте было обработано 250 «мишеней», для поражения которых на машинах участников было проверено более 68 млрд. реальных и пока еще не созданных молекул. 330 млн. молекул показали возможность реакции с белками, так что для лабораторных экспериментов в реальных пробирках очерчено достаточно широкое поле. Ранее администрация Find-a-Drug сообщала, что контрольные проверки моделированных данных в лабораториях «значительно превосходили ожидания».
Закрытие проекта вызвано необычной причиной. У медиков закончились данные, и они, цитируем: «…пришли к выводу, что у нас недостаточно заслуживающих внимания целевых белков, чтобы оправдать продолжение вычислений в 2006 году. Опыт показывает, что для других белков найти партнеров, заинтересованных в результатах исследований, будет очень сложно». Интересно, что к моменту закрытия FaD российская команда стала самой многочисленной. Подробнее о ее достижениях и других инициативах распределенных вычислений, можно прочесть на сайтеwww.Distributed.ru. — В.Н.
15 января в пустыне Юта, закончив свой семилетний полет, успешно приземлилась капсула американского зонда Stardust. Этот проект NASA преследовал две главные цели: сбор фрагментов пыли из хвоста кометы Wild-2 и образцов межзвездного вещества. После долгого путешествия бесценные частицы хорошо бы сразу отправить на алтарь науки, да не тут-то было. Если с относительно крупными и многочисленными кометными фрагментами все просто, то частицы межзвездной пыли очень малы и редки, извлечь их из ловушки — задача нетривиальная.
Вещество, которое послужило космическим пылесборником, имеет губчатую структуру, и искомые образцы находятся, как полагают, где-то внутри. Возможно, современные технологии позволили бы все распылить в прах и отсортировать каждую пылинку, но достижения прогресса решено применить по-другому. Частицы будут искать через… Интернет.
Нет, это не вездесущий Google загодя подготовил новый головокружительный по своим возможностям сервис, да и другие известные игроки поискового интернет-поприща здесь ни при чем. На службу решено поставить методики, уже отработанные во многих проектах распределенных вычислений. Вот только места проникновения пыли внутрь материала участникам придется искать вручную, точнее, с помощью своих собственных глаз.
Видимо, формализовать задачу поиска на поверхности губки «пылевых» отверстий не удалось, и этот случай встал в один ряд с другими не вполне успешно решенными проблемами, связанными с автоматизацией распознавания визуальной информации. Автоматике доверят лишь сканирование всей площади пористого вещества, результатом которого станут 1,5 млн. фотографий. Каждый снимок отправят четырем участникам программы, а те будут тратить уже не время простоя своих ПК, а собственное свободное время для тщательного разглядывания снимков и поиска драгоценных пылинок. Сами устроители сравнивают такую задачу с поиском 45 муравьев на футбольном поле. Именно столько частиц ожидают найти, а вся работа оценивается в 30 тысяч человеко-часов. В награду нашедшему пылинку из космоса будет позволено дать имя… нет, не звезде или астероиду. Той самой найденной пылинке.
