Три разоруженных F-104G построили для NASA, присвоив обозначение F-104N. Их использовали для тренировок астронавтов и сопровождения экспериментальных самолетов. 8 июня 1966 г. F-104N (борт N813NA) стал виновником катастрофы второго опытного образца сверхзвукового бомбардировщика ХВ-70 Valkyrie, произошедшей во время съемки рекламного фильма. Для «массовки» ХВ-70 сопровождали истребители F-4B, F-5, F-104N и тренировочный Т-38. «Старфайтер» пилотировал летчик-испытатель Джон Уокер (Joseph Walker), решивший перелететь через ХВ-70 с переворотом. Однако его самолет задел законцовку правого крыла «Валькирии», перевернулся через фюзеляж бомбардировщика, отбив ему при этом оба киля, ударился о левый элевон и взорвался. Экипаж огромного бомбардировщика не сразу понял, что произошло, и более минуты «Валькирия» продолжала прямолинейный полет, затем перевернулась через крыло, вошла в штопор и упала. Спастись удалось только командиру ХВ-70 Эллу Уайту.
В 1963 г. три F-104G (регистрация DA102, DB127 и DB128)принимали участие в экспериментах по запуску с неподвижной наземной установки при помощи порохового стартового ускорителя по немецкой программе ZELL (Zero-Length Launch — запуск нулевой длинны). Работы проводили специалисты «Локхид» по заказу бундеслюфтваффе. Целью ZELL было рассредоточение F-104G по небольшим площадкам на случай реальной угрозы нападения СССР. Испытания прошли вполне успешно, но на вооружение эту систему не приняли.
Немецкая фирма МВВ переоборудовала один F-104G в летающую лабораторию F-104G-CCVC цифровой электродистанционной системой управления по программе CCV (Control Configured Vehicle). За кабиной пилота под углом 4" был установлен еще один стабилизатор, что переместило аэродинамический фокус вперед. Для компенсации смещения центра масс в хвостовой части закрепили два груза по 300 кг. При этом запас статической устойчивости «Старфайтера» был снижен практически до нуля. Устойчивость в полете обеспечивала только цифровая система управления. Первый полет полностью оборудованного F-104G-CCV летчик-испытатель Нильс Мейстер (Nils Meister) совершил 20 ноября 1980 г. Всего было выполнено около 130 полетов. Результаты испытаний использовались в процессе создания новых истребителей Tornado и Typhoon.
Была предпринята попытка создать всепогодный разведчик RTF-104G1 на базе спарки TF-104G. Построили только один опытный одноместный образец RF-104G-1. Проект закрыли из-за принятия на вооружение в ФРГ разведчика RF-4E Phantom II.
На базе F-104G летчик Дэрил Гринмейер (Daryl Greenamayer) построил самолет F-104RB, предназначенный для установки мировых рекордов скорости. Его оснастили двигателем от истребителя F-4 и системой впрыска воды в компрессор для повышения мощности. Машина была покрашена в красный цвет, за что ее окрестили «Красным бароном». 24 ноября 1977 г. Гринмейеру удалось установить мировой рекорд скорости на базе 3 км — 1590,45 км/ч. Интересно, что во время его пролета от звукового удара взрывались лампочки в фарах автомобилей, которые находились вблизи трассы. В очередном полете «Красный барон» разбился, а Гринмейеру удалось катапультироваться.
Самолет-разведчик RF-104G-EV, оборудованный системой LOROP для фотографирования военных объектов в Китае
Итальянский F-104S ASA из 23-й группы, вооруженный ракетами AIM-9 «Сайдвиндер» и AIM-7 «Спарроу»
Боевое применение
В октябре 1962 г. мир потряс Карибский кризис. F-104C из 479-го TFW были спешно развернуты на базе Кэй Уэст во Флориде. В случае высадки американских войск на Кубе «Старфайтерам» предстояло наносить удары по целям на острове с использованием как обычного, так и ядерного оружия. В одном из патрульных полетов два F-104C были перехвачены парой советских МиГ-21Ф-13 из 32-го Гв.ИАП, размещенного на Кубе. «Старфайтеры» приближались к аэродрому базирования «МиГов» Сан-Антонио на малой высоте, советским пилотам было запрещено применять оружие, они попытались догнать противника и принудить к посадке. Имея превосходство в разгонных характеристиках, F-104С оторвались от преследования и ушли на базу.
Первыми «Старфайтерами», побывавшими в настоящем бою, стали пакистанские F-104A из 9-й эскадрильи с авиабазы Сарготха. К моменту начала войны с Индией в 1965 г. у «Старфайтеров» была блестящая рекламная репутация одного из самых лучших в мире истребителей, и летчикам Р-104Адаже не приходилось вступать в бой — противники в буквальном смысле разбегались кто куда. Пакистанцы даже заявили, что индийский летчик истребителя Gnat, завидев летящий «Старфайтер», сел на ближайшем пакистанском аэродроме и сдался в плен. Правда, по индийским данным «Нэт» сел у противника из-за выработки топлива, однако и это не добавляет героизма индийскому пилоту.
Первую победу летчики F-104А записали 3 сентября 1965 г. Пилотировавший самолет № 56-877 Амджал Хуссейн заявил о сбитии индийского «Нэта» (индийцы не подтвердили). 7 сентября ракетой AIM-9B он сбил еще один самолет противника, на этот раз истребитель-бомбардировщик Mystere IVA. Индийцы отрицают и эту потерю.
На следующий день еще один «Мистер» буквально взорвался в воздухе от пушечной очереди «Старфайтера», который пилотировал Алам Хан. Далее история опять «раздваивается». Пакистанцы утверждают, что пилот F-104A влетел в облако обломков и был вынужден покинуть истребитель, а индийцы говорят о героизме своего летчика, который на горящем самолете преследовал F-104A и подбил его. Последняя сказка нашему сердцу нравится больше, но разум склоняется в пользу версии пакистанской стороны. Ведь если по «Мистеру» дали очередь из 20-мм пушки со скорострельностью 6000 выстрелов в минуту, то его пилот мог догонять противника, в лучшем случае, на катапультном кресле.